285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1445 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1445  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 171 aa  333  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.084347  normal  0.20066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1511  ribosome-binding factor A  62.59 
 
 		 144 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.898255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10330  ribosome-binding factor A  65.94 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.150571  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1212  ribosome-binding factor A  63.38 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.316878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2118  Ribosome-binding factor A-like protein  61.03 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.376562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3329  ribosome-binding factor A  59.21 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.414674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23440  ribosome-binding factor A  61.18 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.487539  normal  0.252109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1020  ribosome-binding factor A  53.9 
 
 		 153 aa  166  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1513  ribosome-binding factor A  66.18 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.121246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1184  ribosome-binding factor A  58.11 
 
 		 189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0780  ribosome-binding factor A  66.67 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3560  ribosome-binding factor A  51.22 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466003  normal  0.834335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3590  ribosome-binding factor A  58.39 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0900161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3189  ribosome-binding factor A  53.37 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0454193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3964  ribosome-binding factor A  55.47 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1427  ribosome-binding factor A  61.03 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000533542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2488  ribosome-binding factor A  60.14 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1417  ribosome-binding factor A  61.03 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0421454  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1329  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 156 aa  147  6e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7740  ribosome-binding factor A  63.24 
 
 		 152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11490  ribosome-binding factor A  53.57 
 
 		 143 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0871158  normal  0.911894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2315  ribosome-binding factor A  50 
 
 		 163 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0767134 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4038  ribosome-binding factor A  54.29 
 
 		 168 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173989  normal  0.432163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2153  ribosome-binding factor A  53.52 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1063  ribosome-binding factor A  57.25 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0406746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1717  ribosome-binding factor A  57.86 
 
 		 157 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.264807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5832  ribosome-binding factor A  59.29 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.154912  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07020  ribosome-binding factor A  50.74 
 
 		 148 aa  134  6.0000000000000005e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1372  ribosome-binding factor A  51.47 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.589597  normal  0.116766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14590  ribosome-binding factor A  58.87 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0231222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2066  ribosome-binding factor A  55.71 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0366548  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2083  ribosome-binding factor A  55.71 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2129  ribosome-binding factor A  55.71 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.0220711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1451  ribosome-binding factor A  55.15 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2209  ribosome-binding factor A  53.66 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000323925  decreased coverage  0.000414746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1744  ribosome-binding factor A  45.19 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388944  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0286  ribosome-binding factor A  46.72 
 
 		 184 aa  110  9e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2049  ribosome-binding factor A  43.24 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1157  ribosome-binding factor A  42.59 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000826248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1587  ribosome-binding factor A  43.75 
 
 		 118 aa  101  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00540002  normal  0.129345 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1436  ribosome-binding factor A  42.86 
 
 		 118 aa  101  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.349731  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12853  ribosome-binding factor A  52.42 
 
 		 183 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.73354e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1445  ribosome-binding factor A  42.06 
 
 		 131 aa  97.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000145103  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0837  ribosome-binding factor A  38.26 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1330  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 130 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.285304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1356  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 116 aa  96.3  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.348543  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2463  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  95.9  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0350107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3552  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 118 aa  95.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3570  ribosome-binding factor A  39.82 
 
 		 118 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3822  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.3299500000000005e-63 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1589  ribosome-binding factor A  42.99 
 
 		 118 aa  94.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00426148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3849  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3662  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3948  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07850  ribosome-binding factor A  39.25 
 
 		 122 aa  94.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3858  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1902  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 122 aa  93.6  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0066847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3633  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0539851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3909  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.391027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1335  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 118 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0231832  hitchhiker  0.00144693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1956  ribosome-binding factor A  41.59 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1304  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 119 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0293197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2980  ribosome-binding factor A  38.74 
 
 		 119 aa  92  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.06185e-26 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1661  ribosome-binding factor A  40.91 
 
 		 121 aa  91.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.661527  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1230  ribosome-binding factor A  40.52 
 
 		 117 aa  88.6  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.644207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1644  ribosome-binding factor A  36.28 
 
 		 119 aa  88.2  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1557  ribosome-binding factor A  38.39 
 
 		 119 aa  87.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1210  ribosome-binding factor A  41.07 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00755575  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1124  ribosome-binding factor A  38.98 
 
 		 121 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.559774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3187  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 119 aa  85.5  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.332882 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0477  ribosome-binding factor A  37.39 
 
 		 126 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00670849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0990  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 123 aa  85.1  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.645083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2895  ribosome-binding factor A  39.32 
 
 		 137 aa  85.1  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.437558  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0927  ribosome-binding factor A  40 
 
 		 119 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100451  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0726  ribosome-binding factor A  35.09 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.237747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0696  ribosome-binding factor A  34.48 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146266  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0458  ribosome-binding factor A  37.07 
 
 		 117 aa  82  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1670  ribosome-binding factor A  37.96 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014786  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4927  ribosome-binding factor A  38.46 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0909  ribosome-binding factor A  40.19 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2665  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1004  ribosome-binding factor A  34.21 
 
 		 129 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.439697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1354  ribosome-binding factor A  38.6 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0964  ribosome-binding factor A  37.17 
 
 		 122 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.404033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0838  ribosome-binding factor A  34.85 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.102995 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3675  ribosome-binding factor A  35.96 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1939  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1657  ribosome-binding factor A  35.71 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0355  ribosome-binding factor A  38.94 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.417644  normal  0.687785 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1863  ribosome-binding factor A  33.33 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01851  ribosome-binding factor A  35.14 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.30308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1052  ribosome-binding factor A  34.86 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1466  ribosome-binding factor A  34.82 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2350  ribosome-binding factor A  31.16 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.840269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62740  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.232446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5461  ribosome-binding factor A  35.29 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1477  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1480  ribosome-binding factor A  36.04 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.243092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1021  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1501  ribosome-binding factor A  36.52 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>