218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1410 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1410  protein of unknown function UPF0027  100 
 
 		 389 aa  792    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0543  protein of unknown function UPF0027  70.44 
 
 		 388 aa  552  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3119  hypothetical protein  66.32 
 
 		 388 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3677  protein of unknown function UPF0027  66.84 
 
 		 385 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1716  protein of unknown function UPF0027  64.56 
 
 		 390 aa  491  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.115138  normal  0.0983851 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1873  hypothetical protein  50.39 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0273  Fis family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 398 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5339  hypothetical protein  48.85 
 
 		 384 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.535527  normal  0.804772 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03272  hypothetical protein  50 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.103712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03224  hypothetical protein  50 
 
 		 408 aa  364  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0813124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3896  RtcB protein  50 
 
 		 408 aa  362  4e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0404  hypothetical protein  51.04 
 
 		 411 aa  362  6e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4729  RtcB protein  49.74 
 
 		 408 aa  362  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0293  hypothetical protein  49.74 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.973171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3618  RtcB protein  49.74 
 
 		 408 aa  362  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0293  protein of unknown function UPF0027  49.74 
 
 		 408 aa  361  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5869  hypothetical protein  50.51 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5432  hypothetical protein  50.25 
 
 		 407 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3701  RtcB protein  49.48 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3829  hypothetical protein  50.25 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2417  hypothetical protein  49.75 
 
 		 428 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0769394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0487  protein of unknown function UPF0027  50 
 
 		 411 aa  358  6e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3587  hypothetical protein  49.75 
 
 		 411 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.588472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1711  protein of unknown function UPF0027  48.21 
 
 		 398 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0858  hypothetical protein  48.94 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3720  conserved protein RtcB  49.22 
 
 		 405 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3827  hypothetical protein  49.22 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3890  RtcB protein  49.48 
 
 		 405 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2130  protein of unknown function UPF0027  48.43 
 
 		 398 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3801  RtcB protein  48.97 
 
 		 408 aa  355  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4671  hypothetical protein  49.25 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.653476  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3692  hypothetical protein  49.25 
 
 		 407 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0224  RTCB protein  51.17 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0235  protein of unknown function UPF0027  51.42 
 
 		 406 aa  352  8.999999999999999e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0678  hypothetical protein  48.72 
 
 		 412 aa  351  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0576  hypothetical protein  51.17 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1946  hypothetical protein  49.75 
 
 		 409 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5225  hypothetical protein  49.87 
 
 		 404 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1193  hypothetical protein  51.04 
 
 		 408 aa  349  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1473  hypothetical protein  47.19 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.375634  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0013  protein of unknown function UPF0027  49.48 
 
 		 407 aa  343  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3893  protein of unknown function UPF0027  50.13 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0530  protein of unknown function UPF0027  48.19 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2770  protein of unknown function UPF0027  47.41 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60650  hypothetical protein  49.35 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4421  protein of unknown function UPF0027  48.84 
 
 		 407 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0498  hypothetical protein  48.04 
 
 		 430 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1273  hypothetical protein  47.57 
 
 		 409 aa  333  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3418  hypothetical protein  46.55 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23210  hypothetical protein  47.86 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280562  normal  0.598303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1411  protein of unknown function UPF0027  49.34 
 
 		 395 aa  312  6.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0164259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1475  protein of unknown function UPF0027  47.53 
 
 		 384 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0639  hypothetical protein  49.22 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.826954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4449  hypothetical protein  47.55 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.317252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1357  hypothetical protein  47.41 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5947  hypothetical protein  45.91 
 
 		 395 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2265  protein of unknown function UPF0027  45.6 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000176241  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3926  hypothetical protein  45.13 
 
 		 407 aa  295  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.449305  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2449  protein of unknown function UPF0027  46.13 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.995987  normal  0.287762 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0012  protein of unknown function UPF0027  46.45 
 
 		 409 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4478  protein of unknown function UPF0027  43.72 
 
 		 394 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00757416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1934  protein of unknown function UPF0027  42.01 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1675  protein of unknown function UPF0027  45.65 
 
 		 715 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.445004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1648  protein of unknown function UPF0027  45.34 
 
 		 715 aa  260  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05440  hypothetical protein  42.71 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2009  hypothetical protein  37.86 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0383885  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1279  protein of unknown function UPF0027  38.16 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000928274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0250  hypothetical protein  31.51 
 
 		 396 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00470202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3458  hypothetical protein  34.99 
 
 		 463 aa  179  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.235018  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0141  hypothetical protein  32.43 
 
 		 484 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0172  hypothetical protein  32.21 
 
 		 498 aa  179  8e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2546  protein of unknown function UPF0027  31.14 
 
 		 400 aa  179  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2835  hypothetical protein  37.01 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0157  hypothetical protein  32.1 
 
 		 484 aa  177  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.540934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3033  hypothetical protein  29.46 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000141174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3800  protein of unknown function UPF0027  29.93 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2736  hypothetical protein  29.2 
 
 		 395 aa  170  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000182015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2997  hypothetical protein  29.2 
 
 		 395 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000377658 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3035  hypothetical protein  30.55 
 
 		 395 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2717  hypothetical protein  29.2 
 
 		 395 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.145401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1757  protein of unknown function UPF0027  32.13 
 
 		 473 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0804  hypothetical protein  32.07 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.671535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2904  hypothetical protein  33.85 
 
 		 470 aa  167  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2787  hypothetical protein  28.68 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.535488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2999  hypothetical protein  28.68 
 
 		 395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000593147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0477  hypothetical protein  31.83 
 
 		 473 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1219  hypothetical protein  31.08 
 
 		 484 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4745  hypothetical protein  32.18 
 
 		 473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256245  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3385  protein of unknown function UPF0027  32.11 
 
 		 462 aa  163  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1373  protein of unknown function UPF0027  31.01 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000549258  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1864  hypothetical protein  31.4 
 
 		 484 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000183648  normal  0.470127 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1252  hypothetical protein  28.98 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0699  protein of unknown function UPF0027  35.06 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.142692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3725  protein of unknown function UPF0027  34.29 
 
 		 508 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.471294 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2615  protein of unknown function UPF0027  31.87 
 
 		 369 aa  159  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2291  protein of unknown function UPF0027  31.41 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.607361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1651  hypothetical protein  31.7 
 
 		 478 aa  155  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5290  hypothetical protein  34.71 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130957 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0155  protein of unknown function UPF0027  30.52 
 
 		 462 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00324351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0909  protein of unknown function UPF0027  32.32 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>