182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1397 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1397  amidohydrolase  100 
 
 
359 aa  684  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.503845  decreased coverage  0.00549847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11020  amidohydrolase, imidazolonepropionase  59.6 
 
 
366 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.161229  normal  0.0546284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2486  amidohydrolase  57.38 
 
 
360 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445092  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1281  amidohydrolase  61.05 
 
 
364 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3462  amidohydrolase 3  61.8 
 
 
365 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  56.82 
 
 
378 aa  368  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2226  amidohydrolase  55.77 
 
 
360 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39869e-10 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1562  amidohydrolase 3  58.61 
 
 
362 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345787  normal  0.0640888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4010  amidohydrolase  60.5 
 
 
361 aa  358  7e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12929  hypothetical protein  55.62 
 
 
370 aa  354  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0687  normal  0.519945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1469  amidohydrolase  54.9 
 
 
362 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5929  amidohydrolase  55.34 
 
 
356 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3262  amidohydrolase  51.53 
 
 
361 aa  338  1e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2182  amidohydrolase  54.11 
 
 
360 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322343  normal  0.931322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1166  amidohydrolase  53.63 
 
 
373 aa  325  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09720  Pro-Hyp dipeptidase  54.52 
 
 
354 aa  324  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.885607 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09960  amidohydrolase, imidazolonepropionase  55 
 
 
388 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0916327  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1960  amidohydrolase  54.43 
 
 
368 aa  312  6e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2006  amidohydrolase  54.43 
 
 
368 aa  312  6e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0811412  normal  0.722686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1940  amidohydrolase  54.43 
 
 
368 aa  312  6e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.864175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4181  amidohydrolase  52.66 
 
 
362 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1191  amidohydrolase  51.25 
 
 
359 aa  293  4e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251504  normal  0.0810275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1612  amidohydrolase  48.06 
 
 
358 aa  282  5e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0569822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1302  amidohydrolase  49.44 
 
 
359 aa  280  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0984  amidohydrolase  43.87 
 
 
358 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  7.13577e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2244  amidohydrolase  49.44 
 
 
367 aa  279  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244187  normal  0.209508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2082  amidohydrolase  48.68 
 
 
357 aa  272  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3142  amidohydrolase  51.18 
 
 
359 aa  266  6e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000508689  normal  0.129698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  29.71 
 
 
433 aa  94.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.11 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  26.4 
 
 
423 aa  87  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  27.23 
 
 
396 aa  85.1  2e-15  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  25.92 
 
 
426 aa  84.3  3e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  25.32 
 
 
423 aa  83.6  5e-15  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.25 
 
 
430 aa  82.8  9e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.89 
 
 
433 aa  82  1e-14  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  30.11 
 
 
438 aa  82.4  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  34.44 
 
 
428 aa  82.4  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.51 
 
 
426 aa  81.6  2e-14  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.29 
 
 
440 aa  80.1  5e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  29.32 
 
 
426 aa  80.5  5e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  33.7 
 
 
394 aa  80.1  6e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  25.96 
 
 
390 aa  80.1  6e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  24.85 
 
 
407 aa  80.1  6e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  25.81 
 
 
413 aa  79  1e-13  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  29.28 
 
 
426 aa  77.8  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.57 
 
 
415 aa  78.6  2e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1571  amidohydrolase  33.33 
 
 
392 aa  77  4e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0206923  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3597  amidohydrolase  29.59 
 
 
445 aa  76.6  7e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  29.29 
 
 
421 aa  75.5  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  26.94 
 
 
408 aa  75.5  1e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  26.94 
 
 
408 aa  75.5  1e-12  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  26.94 
 
 
408 aa  75.5  1e-12  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  22.78 
 
 
401 aa  75.1  2e-12  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18800  amidohydrolase, imidazolonepropionase  31.53 
 
 
416 aa  73.9  4e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0282711  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  29.2 
 
 
413 aa  73.6  5e-12  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  2.7233e-11  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  31.16 
 
 
401 aa  73.6  5e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  8.42595e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  27.95 
 
 
428 aa  73.2  7e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  25.76 
 
 
412 aa  72.8  8e-12  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.74 
 
 
455 aa  71.6  2e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  28.76 
 
 
459 aa  71.6  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  25.22 
 
 
400 aa  71.6  2e-11  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2941  amidohydrolase  28.03 
 
 
390 aa  71.2  3e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.270763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.7 
 
 
421 aa  70.5  4e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  28.77 
 
 
414 aa  70.1  5e-11  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.73 
 
 
432 aa  70.1  5e-11  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  26.45 
 
 
432 aa  69.7  8e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  28.27 
 
 
417 aa  67.8  3e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.27 
 
 
417 aa  67.8  3e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.27 
 
 
417 aa  67.8  3e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  28.18 
 
 
391 aa  67.8  3e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  30.64 
 
 
426 aa  67  5e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  28.81 
 
 
419 aa  67  5e-10  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3738  amidohydrolase  29.51 
 
 
432 aa  66.6  5e-10  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  26.2 
 
 
445 aa  67  5e-10  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  26.63 
 
 
409 aa  66.2  8e-10  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  27.85 
 
 
421 aa  66.2  8e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  26.5 
 
 
434 aa  65.5  1e-09  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  27.47 
 
 
413 aa  65.9  1e-09  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  26.58 
 
 
411 aa  65.5  1e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  28.27 
 
 
424 aa  65.5  1e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.64 
 
 
428 aa  65.9  1e-09  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  26.34 
 
 
433 aa  64.7  2e-09  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2992  amidohydrolase  31.64 
 
 
489 aa  64.3  3e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.278958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  27.65 
 
 
402 aa  64.3  3e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  28.86 
 
 
429 aa  63.9  4e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  34.09 
 
 
409 aa  63.9  4e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  34.09 
 
 
409 aa  63.9  4e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  34.09 
 
 
409 aa  63.9  4e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  27.89 
 
 
411 aa  63.5  5e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  26.06 
 
 
431 aa  63.5  5e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.04 
 
 
404 aa  63.5  5e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4333  amidohydrolase  27.33 
 
 
424 aa  63.2  7e-09  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.48776  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  29.87 
 
 
414 aa  63.2  7e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.76 
 
 
407 aa  62.8  9e-09  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  27.12 
 
 
447 aa  62.4  1e-08  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 
445 aa  62  1e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  26.83 
 
 
420 aa  61.6  2e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  23.65 
 
 
432 aa  61.6  2e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  27.17 
 
 
443 aa  61.2  2e-08  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>