More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1394 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  221  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  176  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  78.38 
 
 		 113 aa  176  9e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 117 aa  155  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 113 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  58.93 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  146  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 		 113 aa  143  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  54.46 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  58.04 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  58.04 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>