More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1392 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1392  signal recognition particle-docking protein FtsY  100 
 
 		 391 aa  736    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292581  decreased coverage  0.00432039 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2234  signal recognition particle-docking protein FtsY  67.09 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014808 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2494  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.34 
 
 		 404 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10960  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.61 
 
 		 480 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0134963  normal  0.0668977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09120  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.47 
 
 		 393 aa  395  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.296605  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1295  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.31 
 
 		 411 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.182603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2775  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.21 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.41655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0658  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.39 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.987967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3596  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.68 
 
 		 414 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3428  signal recognition particle-docking protein FtsY  71.24 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1567  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.68 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0244087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1185  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.02 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291994  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2125  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.92 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147567  normal  0.0509134 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0979  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.27 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1146  signal recognition particle-docking protein FtsY  72.38 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0800411  normal  0.0132649 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1464  signal recognition particle-docking protein FtsY  66.04 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.359002 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1161  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.36 
 
 		 388 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4020  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.35 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8003  signal recognition particle-docking protein FtsY  70.22 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2548  signal recognition particle-docking protein FtsY  63.76 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221459  normal  0.277216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23810  signal recognition particle-docking protein FtsY  62.6 
 
 		 405 aa  363  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235092  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7989  cell division membrane protein  70.19 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0488836  normal  0.407167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1237  signal recognition particle GTPase  61.41 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0220  signal recognition particle-docking protein FtsY  69.62 
 
 		 394 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12935  cell division protein ftsY  57.45 
 
 		 422 aa  355  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000035929  normal  0.45291 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3270  signal recognition particle-docking protein FtsY  61.03 
 
 		 376 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2177  signal recognition particle-docking protein FtsY  58.06 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4186  signal recognition particle-docking protein FtsY  55.44 
 
 		 469 aa  342  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1935  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.84 
 
 		 458 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1955  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.84 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.345625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2001  signal recognition particle-docking protein FtsY  56.84 
 
 		 466 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0072  signal recognition particle-docking protein FtsY  57.93 
 
 		 393 aa  333  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248407 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09610  signal recognition particle-docking protein FtsY  68.79 
 
 		 516 aa  332  8e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640999  normal  0.596403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3150  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.52 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000013579  hitchhiker  0.00179323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5945  signal recognition particle-docking protein FtsY  65.5 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1607  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.05 
 
 		 479 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2077  signal recognition particle-docking protein FtsY  64.01 
 
 		 531 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.0051754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1176  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.1 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.216853  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1184  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.86 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000333894  normal  0.0338709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2460  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 326 aa  266  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3670  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000567512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3895  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0801  cell division protein FtsY  47.68 
 
 		 408 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0242269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3946  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3889  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3606  recognition particle-docking protein  53.03 
 
 		 329 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000396319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3698  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000493228  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3588  recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000596157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3985  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000399496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3861  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.12258e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1297  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.03 
 
 		 329 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000242515  hitchhiker  2.59158e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3746  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.16 
 
 		 405 aa  263  6e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1132  cell division protein FtsY  47.04 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1096  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.84 
 
 		 340 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0138862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3524  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.43 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0157  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.05 
 
 		 481 aa  259  6e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1294  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.65 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000563395  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1319  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.65 
 
 		 416 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000025253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1085  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.87 
 
 		 329 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131602  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13548  recognition particle-docking protein FtsY  49.17 
 
 		 317 aa  257  3e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2499  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.52 
 
 		 329 aa  256  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00080713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0777  Signal recognition particle GTPase-like protein  44.81 
 
 		 305 aa  256  7e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.221787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  42.95 
 
 		 453 aa  255  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0926  signal recognition particle-docking protein FtsY  53.05 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.183665  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3597  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.73 
 
 		 375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549182  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3944  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.63 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000907128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3496  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.86 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000989715  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0560  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.19 
 
 		 506 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000445569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3686  signal recognition particle-docking protein FtsY  51.29 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.915822  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1563  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.9 
 
 		 442 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3767  signal recognition particle-docking protein FtsY  52.69 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000377729  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03537  signal recognition particle GTPase  43.17 
 
 		 541 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0317  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.56 
 
 		 483 aa  252  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1715  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.66 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0121805  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1934  cell division transporter substrate-binding protein FtsY  48.51 
 
 		 362 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.249425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0718  signal recognition particle-docking protein FtsY  50 
 
 		 465 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.073476  hitchhiker  0.00719996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3700  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.84 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.281966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2142  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.59 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0288315  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2067  signal recognition particle-docking protein FtsY  47.39 
 
 		 309 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000959159  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4984  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.91 
 
 		 497 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5111  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.91 
 
 		 494 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0354  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.91 
 
 		 514 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0733  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.98 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1718  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.93 
 
 		 381 aa  250  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000392089  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1366  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.73 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153394  normal  0.233761 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3336  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.54 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1976  signal recognition particle-docking protein FtsY  50.49 
 
 		 328 aa  249  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5161  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.58 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1768  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.67 
 
 		 304 aa  248  2e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00021093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0619  signal recognition particle-docking protein FtsY  40.68 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.124261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0093  cell division protein FtsY  45.51 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4328  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.67 
 
 		 413 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1555  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.89 
 
 		 295 aa  247  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2989  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.56 
 
 		 501 aa  246  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.862274  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3090  signal recognition particle-docking protein FtsY  49.83 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.0202062 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0958  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.47 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1942  signal recognition particle-docking protein FtsY  43.22 
 
 		 373 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00280  signal recognition particle GTPase  45.51 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002138  signal recognition particle receptor protein FtsY  45.62 
 
 		 407 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.745787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4065  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.09 
 
 		 452 aa  246  6.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>