More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1333 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  63.38 
 
 
670 aa  793    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  62.37 
 
 
665 aa  765    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
665 aa  1344    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  46.86 
 
 
667 aa  592  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  41.45 
 
 
667 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  40.65 
 
 
667 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  41.57 
 
 
667 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3216  aldo/keto reductase  45 
 
 
320 aa  249  8e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.300874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3897  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
328 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1199  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
316 aa  218  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  40.06 
 
 
338 aa  199  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 
330 aa  158  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  34.41 
 
 
321 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 
329 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  32.95 
 
 
329 aa  145  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 
334 aa  145  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 
354 aa  145  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  32.56 
 
 
329 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  34.91 
 
 
332 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  33.14 
 
 
346 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  31.27 
 
 
331 aa  140  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  33.91 
 
 
356 aa  137  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  29.91 
 
 
328 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 
320 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 
332 aa  135  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  27.38 
 
 
324 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3685  aldo/keto reductase  32.17 
 
 
320 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2027  aldo/keto reductase  28.83 
 
 
337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  32.36 
 
 
349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  27.54 
 
 
323 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  36.52 
 
 
352 aa  132  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 
338 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  28.7 
 
 
327 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  32.48 
 
 
345 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  29.15 
 
 
329 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  34.76 
 
 
341 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2608  putative oxidoreductase  36.97 
 
 
328 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  32.95 
 
 
321 aa  126  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  34.07 
 
 
352 aa  126  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  29.66 
 
 
328 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  29.77 
 
 
327 aa  122  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  35.79 
 
 
327 aa  121  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0258  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 
336 aa  121  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0215692 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.57 
 
 
338 aa  120  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
332 aa  120  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  34.59 
 
 
354 aa  120  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.49 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  34.38 
 
 
379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  35.61 
 
 
322 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5549  NAD binding oxidoreductase  31.99 
 
 
334 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  34.9 
 
 
338 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  30.95 
 
 
328 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 
344 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  41.22 
 
 
337 aa  117  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  31.46 
 
 
336 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  30.84 
 
 
328 aa  116  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  32.38 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  34.59 
 
 
358 aa  115  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_003296  RS01685  hypothetical protein  31.85 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
312 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  33.82 
 
 
338 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  37.36 
 
 
335 aa  114  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_004310  BR2124  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.49 
 
 
328 aa  113  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.635321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  29.83 
 
 
357 aa  113  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2765  oxidoreductase domain protein  33.72 
 
 
345 aa  113  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  31.58 
 
 
328 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  32.46 
 
 
333 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.86 
 
 
359 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.18 
 
 
328 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.01 
 
 
327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  35.04 
 
 
356 aa  112  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  27.14 
 
 
342 aa  111  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  32.54 
 
 
334 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1025  oxidoreductase domain protein  27.17 
 
 
337 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3482  oxidoreductase domain protein  36.56 
 
 
337 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 
362 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  29.25 
 
 
328 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0791  oxidoreductase domain-containing protein  32.08 
 
 
342 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  34.48 
 
 
447 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  30.99 
 
 
328 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  30.99 
 
 
328 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4517  oxidoreductase-like  31.14 
 
 
330 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  26.63 
 
 
351 aa  107  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1065  oxidoreductase domain-containing protein  30.8 
 
 
335 aa  107  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  28.08 
 
 
342 aa  107  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3596  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 
332 aa  107  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  26.78 
 
 
349 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6432  oxidoreductase domain protein  33.2 
 
 
327 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  35.16 
 
 
338 aa  106  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  28.33 
 
 
315 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 
348 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  32.06 
 
 
328 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 
360 aa  105  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  30.92 
 
 
328 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2724  oxidoreductase domain protein  34 
 
 
331 aa  104  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  30.92 
 
 
324 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.48 
 
 
331 aa  103  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  29.85 
 
 
326 aa  103  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>