More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1261 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  100 
 
 
394 aa  774  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  54.82 
 
 
375 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1064  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  57.73 
 
 
370 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  50.13 
 
 
382 aa  356  5e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1290  glycosyl transferase family 4  56.38 
 
 
372 aa  349  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  55.81 
 
 
369 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  51.74 
 
 
399 aa  328  1e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  46.99 
 
 
427 aa  328  1e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  46.58 
 
 
367 aa  322  5e-87  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19210  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  56.32 
 
 
377 aa  319  6e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  52.05 
 
 
387 aa  313  3e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1754  glycosyl transferase family protein  48.46 
 
 
394 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18290  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  54.46 
 
 
368 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  52.41 
 
 
416 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  45.04 
 
 
404 aa  288  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  43.47 
 
 
425 aa  285  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  45.43 
 
 
405 aa  285  1e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  45.56 
 
 
449 aa  283  3e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  51.94 
 
 
387 aa  283  5e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  45.79 
 
 
402 aa  282  8e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3716  glycosyl transferase family protein  51.03 
 
 
369 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1014  glycosyl transferase family protein  51.03 
 
 
369 aa  280  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.258485  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  45.26 
 
 
403 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
399 aa  274  2e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
399 aa  274  2e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
399 aa  274  2e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3925  glycosyl transferase family 4  48.67 
 
 
383 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2347  glycosyl transferase family 4  44.57 
 
 
370 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  47.22 
 
 
391 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  45.13 
 
 
389 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2614  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
386 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  44.14 
 
 
405 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29630  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  44.92 
 
 
396 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1247  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  45.88 
 
 
405 aa  232  9e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.910947  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  43.78 
 
 
367 aa  231  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08100  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  44.61 
 
 
379 aa  225  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.97 
 
 
391 aa  186  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  3.74023e-07 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 
371 aa  183  5e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.90838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
351 aa  172  8e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
351 aa  172  8e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  38.82 
 
 
354 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  34.25 
 
 
354 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  34.05 
 
 
351 aa  163  5e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  37.15 
 
 
407 aa  162  8e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  35.9 
 
 
348 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  34.16 
 
 
366 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.68413e-06  hitchhiker  4.636e-06 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
521 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  34.77 
 
 
406 aa  159  9e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.46321e-05  unclonable  4.70096e-08 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 
495 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 
376 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
357 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  33.92 
 
 
312 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
357 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  32.64 
 
 
385 aa  154  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
353 aa  154  3e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
357 aa  154  3e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  35.09 
 
 
353 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  36.31 
 
 
357 aa  153  6e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  34.3 
 
 
357 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.3 
 
 
357 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.05483e-08 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.3 
 
 
357 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  33.53 
 
 
380 aa  152  9e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.28029e-07  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.24 
 
 
357 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.24 
 
 
357 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  37.31 
 
 
496 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.55 
 
 
357 aa  148  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3302e-10 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  33.99 
 
 
359 aa  148  2e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
355 aa  148  2e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  34.55 
 
 
357 aa  148  2e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.94 
 
 
386 aa  147  4e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28 
 
 
441 aa  146  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4899  family 4 glycosyl transferase  33.71 
 
 
349 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  34.65 
 
 
340 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.63 
 
 
360 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
361 aa  143  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.98419e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  34.02 
 
 
348 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.55005e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  33.83 
 
 
349 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  32.22 
 
 
762 aa  142  1e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  33.23 
 
 
340 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
369 aa  135  1e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  32.6 
 
 
321 aa  134  2e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  33.71 
 
 
360 aa  132  1e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  30.28 
 
 
326 aa  131  2e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0077  glycosyl transferase family 4  29.66 
 
 
364 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0075  glycosyl transferase family 4  29.66 
 
 
364 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
542 aa  128  2e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3472  glycosyl transferase family 4  29.07 
 
 
360 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.333059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  33.44 
 
 
349 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 
380 aa  126  8e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  1.9692e-06  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
333 aa  125  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 
372 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  32.6 
 
 
336 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1505  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
545 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.4 
 
 
491 aa  123  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
360 aa  122  1e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  26.13 
 
 
329 aa  120  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0167  glycosyltransferase/acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase  30.9 
 
 
353 aa  118  2e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0422469  normal  0.109952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2437  glycosyl transferase family 4  32.61 
 
 
437 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.957951  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1008  glycosyl transferase family 4  31.58 
 
 
317 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2580  glycosyl transferase family 4  29.67 
 
 
554 aa  116  8e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>