More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1223 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
332 aa  652  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.823096  decreased coverage  0.00211171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3687  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  53.7 
 
 
310 aa  299  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822244  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4319  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.65 
 
 
307 aa  238  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.23 
 
 
310 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.797636  normal  0.0345296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.56 
 
 
308 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0100  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.76 
 
 
318 aa  222  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0935  amino acid ABC transporter permease  43.24 
 
 
331 aa  221  2e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.38791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3682  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.33 
 
 
303 aa  219  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.537198  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1067  ABC transporter, permease protein  42.57 
 
 
333 aa  216  5e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.147797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7702  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.61 
 
 
333 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2362  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.68 
 
 
305 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.86 
 
 
307 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.253474  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3033  amino acid ABC transporter permease  44.86 
 
 
307 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2001  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.06 
 
 
335 aa  201  2e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.11761  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3049  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.52 
 
 
307 aa  201  2e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.380934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5577  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.88 
 
 
304 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3767  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.51 
 
 
352 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33193  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27180  amino acid ABC transporter membrane protein  42.77 
 
 
322 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3710  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 
365 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2933  amino acid ABC transporter, permease protein  41.78 
 
 
332 aa  190  3e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.849653  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34670  amino acid ABC transporter membrane protein  41.61 
 
 
374 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220072  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4695  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.42 
 
 
307 aa  185  1e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1161  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  39.26 
 
 
319 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0329373  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
352 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
309 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5407  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
309 aa  175  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5222  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.18 
 
 
318 aa  175  1e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.162381 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0928  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.84 
 
 
329 aa  172  7e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0258353  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02270  amino acid ABC transporter membrane protein  37.85 
 
 
369 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.2 
 
 
307 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0389  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.96 
 
 
326 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503791  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1988  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.06 
 
 
316 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2891  amino acid ABC transporter permease  37.92 
 
 
329 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0444543  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
307 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0279925  normal  0.357497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3010  amino acid ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 
324 aa  164  2e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2853  amino acid ABC transporter permease  35.94 
 
 
292 aa  164  2e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.35 
 
 
290 aa  162  8e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0200727 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.13 
 
 
595 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3798  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.4 
 
 
349 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2097  ABC transporter permease  36.46 
 
 
285 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4596  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.24 
 
 
304 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1317  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.92 
 
 
299 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3517  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
292 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.851369  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.43 
 
 
283 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.83 
 
 
592 aa  148  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
291 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7608  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  36.45 
 
 
290 aa  146  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1700  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.82 
 
 
581 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1531  amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.83 
 
 
619 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.158795 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
597 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.39 
 
 
276 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.715682  normal  0.9196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4188  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.87 
 
 
595 aa  142  1e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346363  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.93 
 
 
594 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4431  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.93 
 
 
597 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.813853  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6458  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.71 
 
 
297 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3935  amino acid ABC transporter permease  35.93 
 
 
597 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140716  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6165  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.31 
 
 
297 aa  139  8e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0904  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.33 
 
 
246 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5127  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
290 aa  137  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4751  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.75 
 
 
224 aa  133  4e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.73498e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  34.95 
 
 
636 aa  133  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.95 
 
 
636 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.21 
 
 
602 aa  132  8e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  36.09 
 
 
636 aa  131  2e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.09 
 
 
636 aa  131  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.09 
 
 
636 aa  131  2e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  36.09 
 
 
636 aa  131  2e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2402  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.09 
 
 
636 aa  131  2e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0471039  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.93 
 
 
594 aa  130  4e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1383  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.83 
 
 
313 aa  127  2e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.535175  normal  0.631655 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2493  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
321 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.761047  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0522  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
306 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2087  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 
306 aa  121  1e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  32.81 
 
 
598 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1185  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
295 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.24 
 
 
314 aa  120  4e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.280897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1479  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 
265 aa  115  1e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121891  normal  0.836923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5510  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.27 
 
 
324 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.442153  decreased coverage  0.000455607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2582  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 
321 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252196  normal  0.376143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0405  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.14 
 
 
311 aa  109  7e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0799  amino acid ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
266 aa  108  9e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2848  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.3 
 
 
323 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566323  normal  0.619807 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1439  amino acid ABC transporter permease  36.8 
 
 
216 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.209302 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2391  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.61 
 
 
217 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0984  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.57 
 
 
339 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0618208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3276  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.57 
 
 
339 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4986  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.75 
 
 
222 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.86981 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0727  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.76 
 
 
503 aa  106  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.79447e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1029  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
216 aa  106  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.938438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3263  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 
323 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0690  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.06 
 
 
273 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0225851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0656  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  33.06 
 
 
273 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.326275  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4040  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.79 
 
 
268 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2801  amino acid ABC transporter permease  34.26 
 
 
281 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0136  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein/permease protein  39.04 
 
 
516 aa  104  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000337877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1293  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
360 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0697282  normal  0.837718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0712  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 
217 aa  104  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4661  amino acid ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
218 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.128052  hitchhiker  2.19299e-21 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0744  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 
217 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.90786  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1011  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  44.53 
 
 
217 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>