More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1158 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1158  MgtE intracellular region  100 
 
 
435 aa  843    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328594  normal  0.0567731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2483  MgtE intracellular region  66.35 
 
 
435 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0317832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0701  MgtE intracellular region  61.48 
 
 
431 aa  494  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2790  MgtE intracellular region  60.53 
 
 
427 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045049  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  60.77 
 
 
427 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27830  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  60.42 
 
 
427 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.885994 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1447  MgtE intracellular region  57.21 
 
 
424 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0766  MgtE intracellular region  62.47 
 
 
430 aa  464  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19370  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  58.39 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0503098  normal  0.0197915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1190  MgtE intracellular region  60.14 
 
 
445 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.067335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8408  MgtE intracellular region  57.74 
 
 
426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.879169  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1818  MgtE intracellular region  61.84 
 
 
429 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.705628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0122  MgtE intracellular region  58.37 
 
 
454 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.522016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2913  MgtE intracellular region  60.44 
 
 
430 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.553029  normal  0.0535058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15330  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  55.88 
 
 
422 aa  428  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.346083  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3817  MgtE intracellular region  59.04 
 
 
447 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446632  normal  0.333957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3009  MgtE intracellular region  57.25 
 
 
402 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.315291  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1134  MgtE intracellular region  58.55 
 
 
412 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0802  MgtE intracellular region  56.12 
 
 
416 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0901  MgtE intracellular region  56.11 
 
 
474 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.885625  normal  0.115332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11290  Mg/Co/Ni transporter MgtE with CBS domain  55.18 
 
 
453 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0664  MgtE intracellular region  55.42 
 
 
427 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.108649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0717  MgtE intracellular region  54.22 
 
 
428 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4488  MgtE intracellular region  53.27 
 
 
431 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.837041  normal  0.0679384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2208  MgtE intracellular region  52.68 
 
 
432 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4001  MgtE intracellular region  52.45 
 
 
431 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114119  normal  0.413173 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4061  MgtE intracellular region  52.45 
 
 
431 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3987  MgtE intracellular region  52.42 
 
 
417 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576405  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11257  hypothetical protein  51.89 
 
 
435 aa  360  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1681  MgtE intracellular region  51.33 
 
 
431 aa  358  7e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000106965  normal  0.399701 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1195  MgtE intracellular region  48.83 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1864  MgtE intracellular region  49.3 
 
 
438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2338  MgtE intracellular region  35.28 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1738  MgtE intracellular region  29.9 
 
 
430 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2041  MgtE intracellular region  27.7 
 
 
426 aa  159  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0076  MgtE intracellular region  30.11 
 
 
459 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.740588  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0069  MgtE intracellular region  29.93 
 
 
625 aa  147  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0656  MgtE intracellular region  28.44 
 
 
417 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000076098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3240  MgtE intracellular region  26.62 
 
 
433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1158  MgtE intracellular region  29.86 
 
 
420 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7400  hypothetical protein  31.51 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.090921  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4217  magnesium transporter  39.33 
 
 
452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0595  CBS domain-containing protein  32.84 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297001  normal  0.536913 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0481  magnesium transporter  36.6 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000026878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03755  magnesium transporter  33.06 
 
 
449 aa  124  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.578894  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1530  CBS domain-containing protein  25 
 
 
423 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000568419  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2168  magnesium transporter  36.89 
 
 
453 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.571792  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1323  CBS domain-containing protein  24.77 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4147  magnesium transporter  31.6 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.235845 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0475  MgtE intracellular region  31.82 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0596  magnesium transporter  29.73 
 
 
451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000141787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2720  magnesium transporter  32.79 
 
 
453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.786081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1691  magnesium transporter  33.89 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0276763 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2396  CBS domain-containing protein  26.24 
 
 
425 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0891  magnesium transporter  33.18 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182098 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1007  magnesium transporter  30.08 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1026  magnesium transporter  30.08 
 
 
461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000394015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3966  magnesium transporter  31.37 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2169  magnesium transporter  28.1 
 
 
449 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0667  magnesium transporter  32.16 
 
 
454 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.126448 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1461  magnesium transporter  29.44 
 
 
463 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00122115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1832  magnesium transporter  34.1 
 
 
460 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0187947  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0668  magnesium transporter  31.76 
 
 
454 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.175865  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3354  magnesium transporter  31.76 
 
 
454 aa  109  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.399526  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6844  magnesium transporter  33.9 
 
 
454 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.724655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2656  Mg/Co/Ni transporter MgtE  28.68 
 
 
412 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0714  magnesium transporter  31.3 
 
 
449 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0809  magnesium transporter  31.06 
 
 
542 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0710  magnesium transporter  31.37 
 
 
454 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000631089  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1689  magnesium transporter  30.13 
 
 
449 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl217  Mg/Co/Ni transporter  25.4 
 
 
468 aa  106  8e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.153216  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2831  magnesium transporter  30.71 
 
 
458 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2291  magnesium transporter  27.99 
 
 
449 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12500  magnesium transporter  28.82 
 
 
442 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0589  magnesium transporter  32.12 
 
 
461 aa  102  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.124828  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0824  magnesium transporter  30.49 
 
 
454 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0681  magnesium transporter  30.2 
 
 
454 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299447  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3673  magnesium transporter  30.2 
 
 
454 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0193522  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0702  magnesium transporter  30.2 
 
 
454 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.952021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0711  magnesium transporter  30.2 
 
 
454 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194916  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1642  magnesium transporter  29.66 
 
 
462 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0331  magnesium transporter  30.89 
 
 
458 aa  101  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2879  magnesium transporter  30.91 
 
 
451 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1669  magnesium transporter  30.45 
 
 
462 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2352  magnesium transporter  29.72 
 
 
468 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814401  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2600  magnesium transporter  31.06 
 
 
463 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6729  magnesium transporter  30.87 
 
 
463 aa  100  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143213  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1980  magnesium transporter  29.41 
 
 
451 aa  100  6e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2089  magnesium transporter  29.26 
 
 
460 aa  100  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2520  magnesium transporter  35.06 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.624288 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1588  response regulator receiver protein  28.83 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0822  magnesium transporter  29.8 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0876  magnesium transporter  29.8 
 
 
465 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25770  Mg2+ transporter MgtE  28.19 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4245  magnesium transporter  29.3 
 
 
454 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.036971  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0725  magnesium transporter  28.33 
 
 
484 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3622  magnesium transporter  30.08 
 
 
454 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.135678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0092  MgtE intracellular region  24.23 
 
 
425 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0286357 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0412  magnesium transporter  31.17 
 
 
461 aa  97.4  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1654  response regulator receiver protein  28.83 
 
 
446 aa  97.4  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.399924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>