10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1152 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1152  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0820986  normal  0.0109963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3013  putative transmembrane anti-sigma factor  37.41 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.879358  normal  0.937145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8415  putative transmembrane anti-sigma factor  45.57 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0624926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3832  hypothetical protein  47.76 
 
 		 277 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.0291637 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7940  hypothetical protein  38.46 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1211  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3890  hypothetical protein  34.18 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1184  putative transmembrane anti-sigma factor  32.5 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.58074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2514  putative transmembrane anti-sigma factor  41.3 
 
 		 285 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000642877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2794  hypothetical protein  41.86 
 
 		 357 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.853629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>