More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1118 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  100 
 
 		 316 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  51.99 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  50.67 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  48.68 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  49.83 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  50.99 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  46.69 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  46.69 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  46.69 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  45.39 
 
 		 334 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  48.38 
 
 		 335 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  47.99 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  43.22 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  49.84 
 
 		 310 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  46.2 
 
 		 316 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  46.08 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  45.42 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  44.77 
 
 		 317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  42.02 
 
 		 326 aa  212  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  43.85 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  44.67 
 
 		 300 aa  202  9e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  44.1 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  42.38 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  41.85 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  42.02 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  42.58 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  40.4 
 
 		 326 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  40.07 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  41.96 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  41.77 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  41.25 
 
 		 306 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  39.09 
 
 		 311 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  37.1 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  38.76 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  40.65 
 
 		 320 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.71 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  34.74 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  34.29 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 308 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  39.68 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  37.34 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  38.94 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  35.78 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  35.56 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 319 aa  143  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  32.79 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  35.67 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  38.1 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  32.79 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  38.78 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  45.98 
 
 		 251 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  36.39 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.7 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  35.64 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  38.78 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  33.76 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  37.35 
 
 		 319 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  35.28 
 
 		 306 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  35.92 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  35.92 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  39.55 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  35.52 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  36.65 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  32.79 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.71 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  35.53 
 
 		 315 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  34.69 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  31.44 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.7 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.9 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.41 
 
 		 315 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.63 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.08 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 		 322 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.92 
 
 		 315 aa  99  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.92 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  35.81 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  26.8 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  26.8 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  31.58 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  29.3 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.69 
 
 		 306 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.1 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>