More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1062 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  802  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6400  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
389 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
405 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.25 
 
 
373 aa  115  1e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  28.92 
 
 
401 aa  115  2e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
394 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  36.41 
 
 
353 aa  112  1e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 
360 aa  105  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
392 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
370 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 
367 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 
446 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  1.95577e-05 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
387 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  33.85 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  29.02 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  30.8 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  33.9 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  37 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.83 
 
 
370 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 
374 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
390 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
390 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
377 aa  94  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  3.08882e-10 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
394 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.9 
 
 
410 aa  94  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
391 aa  92.8  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  37.8 
 
 
385 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  35.29 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
445 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
426 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 
373 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  33.95 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
363 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  37.56 
 
 
406 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  35.98 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  35.67 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
410 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4271  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  22.2 
 
 
403 aa  89.7  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  27.96 
 
 
441 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  24.33 
 
 
395 aa  90.1  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.98 
 
 
770 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  22.44 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
678 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
810 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  25.86 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 
382 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 
366 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
669 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  34.7 
 
 
408 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
748 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  23.83 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  34.05 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 
426 aa  87.8  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  23 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  37.66 
 
 
377 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
377 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.48 
 
 
360 aa  86.3  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.5 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
414 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  36.26 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  30.43 
 
 
404 aa  85.9  1e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 
427 aa  85.5  1e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 
384 aa  85.9  1e-15  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
359 aa  85.9  1e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
448 aa  85.9  1e-15  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  22.27 
 
 
404 aa  85.9  1e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
383 aa  84.7  2e-15  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 
373 aa  85.5  2e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.94 
 
 
426 aa  85.1  2e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 
392 aa  85.1  2e-15  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  35.98 
 
 
393 aa  85.5  2e-15  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
371 aa  85.1  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
425 aa  85.1  2e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.63553e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  27.54 
 
 
388 aa  85.1  2e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
415 aa  85.5  2e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  31.22 
 
 
416 aa  84.3  3e-15  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2168  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
399 aa  84.3  3e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 
381 aa  84.3  3e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
476 aa  84.3  3e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 
412 aa  84.7  3e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  34.52 
 
 
392 aa  84.7  3e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
376 aa  84.7  3e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>