More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1050 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 225 aa  447  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 245 aa  279  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  70.77 
 
 		 221 aa  278  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 205 aa  274  8e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  67.63 
 
 		 271 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  64.25 
 
 		 330 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  66.17 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  65.33 
 
 		 218 aa  271  6e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  63.98 
 
 		 231 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  63.55 
 
 		 216 aa  268  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  65.09 
 
 		 317 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  64 
 
 		 200 aa  265  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 205 aa  263  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  63.13 
 
 		 204 aa  263  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  62.02 
 
 		 215 aa  261  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  62.44 
 
 		 199 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  61.08 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  62.38 
 
 		 218 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 		 212 aa  255  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 227 aa  254  6e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  59.22 
 
 		 226 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  62.56 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  58.96 
 
 		 220 aa  238  6.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 273 aa  220  9.999999999999999e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  52.74 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 215 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 224 aa  92.4  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 237 aa  88.6  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 206 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 224 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 256 aa  78.2  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  30.92 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  29.6 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.83 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  27.6 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  33.6 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  26.02 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 193 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>