More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1008 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  100 
 
 		 510 aa  1047    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  65.27 
 
 		 498 aa  642    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  76.69 
 
 		 506 aa  769    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  77.64 
 
 		 505 aa  818    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  76.49 
 
 		 505 aa  783    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  75.9 
 
 		 505 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  76.25 
 
 		 517 aa  810    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  78.93 
 
 		 505 aa  810    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  75.49 
 
 		 510 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  76.29 
 
 		 505 aa  787    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  60.91 
 
 		 505 aa  647    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  76.29 
 
 		 505 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  75.49 
 
 		 510 aa  816    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  76.29 
 
 		 505 aa  790    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  79.88 
 
 		 505 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  75.49 
 
 		 510 aa  814    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  62.35 
 
 		 505 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  61.75 
 
 		 507 aa  630  1e-179  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  63.22 
 
 		 504 aa  626  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  61.71 
 
 		 504 aa  626  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  60.64 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  59.73 
 
 		 514 aa  622  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  63.35 
 
 		 504 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  59.08 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  63.22 
 
 		 504 aa  620  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  62.23 
 
 		 506 aa  617  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  62.08 
 
 		 499 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  62.85 
 
 		 510 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  60.04 
 
 		 505 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  63.93 
 
 		 496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  61.51 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61.08 
 
 		 509 aa  596  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  62.4 
 
 		 504 aa  596  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  60.08 
 
 		 498 aa  593  1e-168  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  59.05 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  60.6 
 
 		 499 aa  592  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  59.08 
 
 		 499 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  61.11 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  57.88 
 
 		 499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  58.72 
 
 		 501 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  57.48 
 
 		 509 aa  579  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  57.88 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  57.68 
 
 		 504 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  58.76 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  59.56 
 
 		 502 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  57.77 
 
 		 505 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  59.16 
 
 		 501 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  58.76 
 
 		 501 aa  571  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  55.71 
 
 		 496 aa  569  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  57.85 
 
 		 497 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  55.11 
 
 		 496 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  56.4 
 
 		 507 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.09 
 
 		 497 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  56.09 
 
 		 498 aa  563  1.0000000000000001e-159  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  59.34 
 
 		 514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  55.8 
 
 		 507 aa  554  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  55.91 
 
 		 522 aa  553  1e-156  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  54.13 
 
 		 510 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  55.6 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  55.6 
 
 		 507 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  57.49 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  56.89 
 
 		 499 aa  548  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  52.54 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  53.02 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03811  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4059  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4366  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  53.74 
 
 		 499 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4092  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  52.62 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  52.62 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  52.82 
 
 		 496 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  53.36 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  52.62 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03760  hypothetical protein  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  54.2 
 
 		 520 aa  535  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4460  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  53.35 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  52.62 
 
 		 496 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5381  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  53.54 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4157  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.98 
 
 		 502 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  52.82 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  52.42 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  52.62 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  53.91 
 
 		 501 aa  531  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  53.16 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  52.62 
 
 		 496 aa  534  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53.29 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  53.09 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  52.89 
 
 		 499 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1561  glycerol kinase  53.54 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4408  glycerol kinase  53.56 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  53.61 
 
 		 495 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3815  glycerol kinase  54.14 
 
 		 498 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17960  glycerol kinase  53.54 
 
 		 505 aa  531  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.155837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  53.16 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  53.16 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  53.16 
 
 		 502 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>