95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1005 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1005  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  758    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  decreased coverage  0.00044241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3466  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 409 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488315  normal  0.151148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2303  major facilitator superfamily protein  34.85 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.569789  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0371  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6779  hypothetical protein  32.5 
 
 		 396 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.474799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5238  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0971  major facilitator superfamily MFS_1  35.8 
 
 		 412 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.935255  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1689  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0585  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2483  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2789  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0256  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0048883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3536  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3195  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000039587 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01430  arabinose efflux permease family protein  30.49 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4779  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.863308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4875  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.615718  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4653  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.523264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3935  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.253599  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0953  hypothetical protein  28.97 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0234  transmembrane efflux protein  27.22 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0247796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5100  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404001  normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0686  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 417 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3782  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7368  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2693  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 398 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0742009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6310  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2914  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00730605  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2846  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 410 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0835154  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3030  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 408 aa  106  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.54277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4978  putative ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.80843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3637  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4443  transporter, putative  31.86 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.145391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2206  putative transporter  28.5 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36140  arabinose efflux permease family protein  30.54 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2972  hypothetical protein  30.52 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.355188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1842  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.570111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0452  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1712  major facilitator superfamily MFS_1  32.56 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.190703  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35230  hypothetical protein  30.65 
 
 		 401 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.578304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12160  arabinose efflux permease family protein  32.39 
 
 		 395 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.541779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0458  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3286  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 430 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4039  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0252  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1151  transporter, major facilitator family protein  25.6 
 
 		 464 aa  90.1  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.469234 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4959  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 407 aa  90.1  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.6026  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1671  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 414 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3415  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2591  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0426  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.258686  normal  0.0618447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1095  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.522817  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3577  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.194075  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0984  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  hitchhiker  0.00222704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1898  hypothetical protein  29.44 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3961  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.357684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1865  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3629  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1250  major facilitator superfamily protein  29.28 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13000  arabinose efflux permease family protein  30.71 
 
 		 453 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0578  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12350  Major Facilitator Superfamily transporter  30.18 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1188  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0163  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1267  putative permease  32.63 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28500  Major Facilitator Superfamily transporter  29.19 
 
 		 437 aa  64.3  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0780  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.347678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0221  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2521  aspartyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 		 1019 aa  61.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.563997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36350  arabinose efflux permease family protein  27 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1478  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000064955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3243  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0153941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2992  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 413 aa  57  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1475  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 433 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.467651  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07470  Major Facilitator Superfamily transporter  32.3 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.472648  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1175  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62148  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4650  hypothetical protein  27.52 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  0.232037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.16 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0165  hypothetical protein  31.09 
 
 		 177 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2605  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 407 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0200  hypothetical protein  30.57 
 
 		 177 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0224  hypothetical protein  30.57 
 
 		 177 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 423 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0171  membrane transport protein; multidrug resistance protein  29.3 
 
 		 177 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0181  hypothetical protein  29.3 
 
 		 177 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0179  hypothetical protein  29.3 
 
 		 177 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0200  hypothetical protein  29.3 
 
 		 177 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>