More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1001 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 554 aa  1130    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  59.49 
 
 		 557 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  63.47 
 
 		 584 aa  713    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  62.48 
 
 		 552 aa  706    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  50.72 
 
 		 568 aa  588  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  40 
 
 		 563 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.57 
 
 		 550 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  35.78 
 
 		 556 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  34.72 
 
 		 527 aa  333  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  33.88 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  33.88 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  33.88 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  34 
 
 		 527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  32.79 
 
 		 529 aa  312  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  35.28 
 
 		 545 aa  311  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  34.12 
 
 		 532 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  34 
 
 		 533 aa  306  6e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.88 
 
 		 518 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  34.3 
 
 		 531 aa  302  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.67 
 
 		 528 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  33.03 
 
 		 531 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.29 
 
 		 534 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.34 
 
 		 531 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.33 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.3 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  33.53 
 
 		 538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  30.4 
 
 		 583 aa  286  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.92 
 
 		 540 aa  282  1e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  34.42 
 
 		 521 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.09 
 
 		 521 aa  280  5e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.26 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  33.69 
 
 		 532 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.01 
 
 		 531 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  30.43 
 
 		 559 aa  259  8e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 579 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.59 
 
 		 534 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.27 
 
 		 536 aa  250  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  32.86 
 
 		 534 aa  249  9e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 531 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  33.87 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  31.98 
 
 		 520 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.11 
 
 		 586 aa  248  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  33.33 
 
 		 527 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  31.38 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.69 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  33.46 
 
 		 502 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  29.29 
 
 		 554 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.99 
 
 		 564 aa  225  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.15 
 
 		 467 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  29.84 
 
 		 470 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  27.49 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.2 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.72 
 
 		 516 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.83 
 
 		 516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.88 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  27.29 
 
 		 513 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 		 572 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.86 
 
 		 523 aa  150  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  29.53 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  27.59 
 
 		 517 aa  143  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  24.73 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.52 
 
 		 484 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  24.52 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  24.52 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  24.52 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  24.52 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  24.31 
 
 		 484 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  24.31 
 
 		 484 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  24.09 
 
 		 484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.33 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  22.64 
 
 		 451 aa  116  8.999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  25 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3226  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.52 
 
 		 463 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.339169  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0202  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.01 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.243944 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.79 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3322  FAD linked oxidase domain protein  31.27 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00350215  normal  0.0147191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  24.67 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.3 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2348  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.79 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152585 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  23.73 
 
 		 463 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3536  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.5 
 
 		 463 aa  100  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  23.67 
 
 		 474 aa  100  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3278  glycolate oxidase, GlcD subunit  23.06 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0069912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.06 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0111  FAD linked oxidase-like  23.63 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  22.84 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  23.5 
 
 		 463 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3530  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  23.5 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3315  glycolate oxidase subunit GlcD  23.5 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3575  glycolate oxidase subunit GlcD  23.5 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.153752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0052  FAD linked oxidase domain protein  22.25 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  23.96 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0483  FAD linked oxidase-like  25.32 
 
 		 468 aa  97.8  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  0.101905 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  25.38 
 
 		 468 aa  97.8  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1317  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.81 
 
 		 461 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.107956  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52647  mitochondrial lactate ferricytochrome c oxidoreductase  28.64 
 
 		 489 aa  94.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.172036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  23.97 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  23.04 
 
 		 474 aa  94.7  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>