66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0967 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  100 
 
 
475 aa  930    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  44.57 
 
 
695 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  51.2 
 
 
306 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  44.03 
 
 
654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  45.32 
 
 
396 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  44.44 
 
 
351 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  43.02 
 
 
780 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  46.04 
 
 
664 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  39.48 
 
 
928 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.53 
 
 
846 aa  146  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  37.13 
 
 
1040 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  37.13 
 
 
967 aa  136  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  43.78 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  46.58 
 
 
316 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  35.97 
 
 
322 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  37.02 
 
 
867 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  40.08 
 
 
879 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  41.24 
 
 
546 aa  115  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  41.9 
 
 
617 aa  113  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  30.36 
 
 
595 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  37.56 
 
 
892 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  46.23 
 
 
300 aa  86.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  30.82 
 
 
686 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  36.93 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  31.94 
 
 
708 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  45.45 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  38.41 
 
 
205 aa  77  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  40.8 
 
 
399 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  30 
 
 
706 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  30 
 
 
754 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  30 
 
 
705 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  34.42 
 
 
344 aa  70.5  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  41.58 
 
 
539 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  41.75 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  37.29 
 
 
539 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  43.69 
 
 
537 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  43.69 
 
 
537 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  43.69 
 
 
537 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  28.35 
 
 
699 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  39.22 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  33.56 
 
 
312 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3166  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.14 
 
 
461 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.28 
 
 
275 aa  55.1  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0111615  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  25.69 
 
 
244 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3165  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.89 
 
 
568 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.845212  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  26.28 
 
 
167 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2948  Allergen V5/Tpx-1 related  28.24 
 
 
280 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1208  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  26.15 
 
 
263 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1346  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1306  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1384  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2546  hypothetical protein  33.8 
 
 
270 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1407  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1186  hypothetical protein  26.15 
 
 
270 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1448  hypothetical protein  26.15 
 
 
275 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3878  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.35 
 
 
588 aa  47  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2435  SCP-like extracellular  24.73 
 
 
270 aa  47  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1705  Allergen V5/Tpx-1 related  25.37 
 
 
245 aa  46.6  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000015674  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3865  SCP-like extracellular  30 
 
 
207 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.348195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1016  hypothetical protein  25.38 
 
 
283 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.768354  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  28.24 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3998  hypothetical protein  25.38 
 
 
270 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0752047 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  22.3 
 
 
347 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  24.57 
 
 
458 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0081  Allergen V5/Tpx-1 family protein  28.24 
 
 
321 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>