25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0960 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  301  3e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  51.15 
 
 
162 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  44.08 
 
 
156 aa  114  4e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  40.46 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  41.94 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  46.46 
 
 
128 aa  90.9  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  41.94 
 
 
140 aa  81.6  4e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  41.96 
 
 
141 aa  78.6  4e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  40.94 
 
 
188 aa  76.6  1e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  41.46 
 
 
140 aa  76.3  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  37.14 
 
 
197 aa  73.9  7e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  41.32 
 
 
200 aa  70.9  8e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  35.34 
 
 
201 aa  65.9  2e-10  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  35.94 
 
 
136 aa  59.7  2e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  40.66 
 
 
162 aa  57  1e-07  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2469  hypothetical protein  28.42 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.63678e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0350  hypothetical protein  38.24 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2693  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2712  hypothetical protein  48.65 
 
 
287 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  28.42 
 
 
541 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.32167e-12 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  28.42 
 
 
541 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2508  hypothetical protein  48.65 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  8.91138e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  47.22 
 
 
135 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3588  hypothetical protein  35.56 
 
 
122 aa  41.6  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.176782  normal  0.0999018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>