More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0958 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 268 aa  521  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  50.99 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  40.08 
 
 		 280 aa  145  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.25 
 
 		 325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.41 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  33.47 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  36.21 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  32.16 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 285 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 271 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.52 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 267 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 285 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  57.5 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.79 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  25.69 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  22.39 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  40.24 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0994  AraC family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  20.97 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.68 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  40.7 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  26.56 
 
 		 530 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4202  AraC family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  22.93 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2749  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981488  normal  0.351056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  34.58 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  38.46 
 
 		 289 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2016  transcriptional regulator, AraC family  20.73 
 
 		 279 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 409 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  31.45 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  31.45 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  22.73 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  31.45 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 409 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  39.02 
 
 		 396 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  32.26 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 410 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  31.45 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0974  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 313 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.323377  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 396 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3034  two component AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 556 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00618221  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.56 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>