More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0918 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 394 aa  734    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  62.18 
 
 		 393 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  57.69 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  59.69 
 
 		 409 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  61.07 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  61.68 
 
 		 393 aa  359  5e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  57.36 
 
 		 395 aa  349  4e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  59.33 
 
 		 386 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  59.34 
 
 		 401 aa  338  8e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  58.29 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  59.74 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  58.06 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  59.13 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  55.41 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  56.45 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  51.04 
 
 		 384 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  50.78 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  50.78 
 
 		 384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  55.91 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  49.46 
 
 		 385 aa  280  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  52.66 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  52.53 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  39.68 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  40.1 
 
 		 403 aa  195  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.5 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.5 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  33.25 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  33.5 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.5 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.72 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  33.25 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.5 
 
 		 407 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.72 
 
 		 393 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.52 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  36.63 
 
 		 400 aa  176  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.65 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.65 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  34.12 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  34.38 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.12 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.38 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.38 
 
 		 399 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.86 
 
 		 399 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  34.12 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.12 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  37.17 
 
 		 405 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  35.18 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  37.44 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  36.27 
 
 		 411 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  35.98 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  30.35 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  30.92 
 
 		 586 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.61 
 
 		 586 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.81 
 
 		 587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  30.67 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.6 
 
 		 585 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  30.42 
 
 		 586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.75 
 
 		 585 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.67 
 
 		 587 aa  113  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  32.11 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  29.91 
 
 		 747 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0891  sodium/hydrogen exchanger  30.29 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.155242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  24.69 
 
 		 745 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 585 aa  106  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  30.15 
 
 		 782 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  29.07 
 
 		 513 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  25.54 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  31.11 
 
 		 585 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  24.73 
 
 		 375 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2576  sodium/hydrogen exchanger  28.98 
 
 		 757 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  29 
 
 		 664 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.3 
 
 		 741 aa  100  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  24.73 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.73 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  24.73 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  24.73 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  32.2 
 
 		 673 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  32.79 
 
 		 563 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  24.46 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  28.42 
 
 		 654 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  25.8 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  29.65 
 
 		 585 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 		 777 aa  96.7  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  24.46 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  27.32 
 
 		 741 aa  96.3  8e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  31.38 
 
 		 562 aa  96.3  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  24.19 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  24.19 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  30.4 
 
 		 720 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  28.57 
 
 		 474 aa  95.5  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  25.68 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.07 
 
 		 671 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1810  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 		 771 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  28.29 
 
 		 666 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>