More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0908 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0908  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 353 aa  691    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00327359  normal  0.0207813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4176  cation diffusion facilitator family transporter  45.69 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  0.120202 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3015  cation diffusion facilitator family transporter  46.3 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4489  cation diffusion facilitator family transporter  49.22 
 
 		 298 aa  222  7e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0696938  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1141  cation diffusion facilitator family transporter  42.12 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1782  cation efflux protein  38.54 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15840  cation diffusion facilitator family transporter  43.18 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0295816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01760  cation transport protein  40.75 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.664458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1360  cation diffusion facilitator family transporter  41.41 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733609  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18150  cation diffusion facilitator family transporter  44.98 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.040003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3754  cation diffusion facilitator family transporter  40.63 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  0.0201065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0065  cation diffusion facilitator family transporter  40.52 
 
 		 329 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3687  cation diffusion facilitator family transporter  45.25 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.271523 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2798  cation diffusion facilitator family transporter  36.51 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1390  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 309 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4110  cation diffusion facilitator family transporter  37.04 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04980  cation diffusion facilitator family transporter  36.86 
 
 		 351 aa  179  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1776  cation diffusion facilitator family transporter  39.09 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0759  cation diffusion facilitator family transporter  37.77 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  0.101295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0733  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.299752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3824  cation diffusion facilitator family transporter  37.59 
 
 		 283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2205  cation diffusion facilitator family transporter  40.91 
 
 		 317 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.244213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4628  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 		 308 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0300132  normal  0.143648 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1771  cation transporter, permease component  34.34 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.52517  normal  0.0251557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2733  cation diffusion facilitator family transporter  35.59 
 
 		 303 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.924366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0824  cation diffusion facilitator family transporter  33.75 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6323  cation diffusion facilitator family transporter  37.21 
 
 		 305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.275453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4497  cation diffusion facilitator family transporter  37.12 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4836  cation diffusion facilitator family transporter  36.22 
 
 		 344 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.07629  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0719  cation diffusion facilitator family transporter  35.79 
 
 		 317 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.176085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0314  cation diffusion facilitator family transporter  37.72 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00366516  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4060  cation diffusion facilitator family transporter  36.84 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.978964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4319  cation diffusion facilitator family transporter  35.26 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.337852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0438  cation diffusion facilitator family transporter  30.49 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1337  cation diffusion facilitator family transporter  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4688  cation diffusion facilitator family transporter  34.94 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.105315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1593  cation diffusion facilitator family transporter  40.68 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.315476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26540  cation diffusion facilitator family transporter  32.9 
 
 		 426 aa  153  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0548124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4528  cation diffusion facilitator family transporter  35.88 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4358  cation diffusion facilitator family transporter  35 
 
 		 312 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0273314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1671  cation diffusion facilitator family transporter  39.49 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2745  cation diffusion facilitator family transporter  32.5 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5899  cation diffusion facilitator family transporter  35.57 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.847836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1222  cation diffusion facilitator family transporter  35.31 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0856853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4859  cation diffusion facilitator family transporter  37.46 
 
 		 310 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3642  cation diffusion facilitator family transporter  37.54 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0337  cation diffusion facilitator family transporter  33.55 
 
 		 317 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2403  cation diffusion facilitator family transporter  37.42 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0831069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0843  CDF family heavy metal/H(+) antiporter  36.22 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0964  cation diffusion facilitator family transporter  34.11 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1482  cation diffusion facilitator family transporter  33.66 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1993  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_13994  predicted protein  31.6 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455794  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09160  cation diffusion facilitator family transporter  36.03 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.236518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1307  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4986  cation diffusion facilitator family transporter  32.43 
 
 		 318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.992274 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2294  cation diffusion facilitator family transporter  39.04 
 
 		 316 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.547422  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0901  cation diffusion facilitator family transporter  31.8 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.549098  normal  0.0315614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1655  cation diffusion facilitator family transporter  37.8 
 
 		 318 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1535  cation transporter  32.04 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000520481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6007  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000180235  normal  0.0482641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4570  cation diffusion facilitator family transporter  36.09 
 
 		 308 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39741  CDF family transporter: cation efflux  30.99 
 
 		 345 aa  122  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.96 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0076  cation diffusion facilitator family transporter  29.82 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.097535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1617  cation diffusion facilitator family transporter  29.15 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08140  cation diffusion facilitator family transporter  25.8 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.150714  normal  0.172071 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  31.25 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0970  cation diffusion facilitator family transporter  21.53 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000558459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  29.68 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  29.05 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  24.45 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2250  cation diffusion facilitator family transporter  30.85 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000133165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  32.12 
 
 		 292 aa  62.4  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  26.17 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0938  cation diffusion facilitator family transporter  26.3 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0198  cation diffusion facilitator family transporter  27.82 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.859565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2100  cation diffusion facilitator family transporter  28.14 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.70845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4529  cation efflux family protein  27.75 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  26.48 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4257  cation diffusion facilitator family transporter  29.13 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0706  cation efflux family protein  31.07 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4494  cation efflux family protein  28.16 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  17.63 
 
 		 392 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4544  cation efflux family protein  30.1 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4305  cation efflux family protein  30.1 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4143  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.1 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4154  cation efflux family protein; cobalt-zinc-cadmium resistance protein  30.1 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4640  cation efflux family protein  30.1 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4490  cation efflux family protein  30.1 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000013867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3430  cation efflux family protein  28.12 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.038315  normal  0.371724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  28.08 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  28.23 
 
 		 466 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3964  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0559635  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3126  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3626  cation diffusion facilitator family transporter  34.44 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89177 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  29.68 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  23.13 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  28.68 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  30.33 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>