152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0870 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  100 
 
 		 206 aa  418  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  58.74 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  59.71 
 
 		 205 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  59.22 
 
 		 205 aa  248  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  59.71 
 
 		 205 aa  248  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  61.65 
 
 		 206 aa  248  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  57.77 
 
 		 205 aa  242  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  55.34 
 
 		 206 aa  236  1e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  54.29 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  52.91 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  56.86 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  52.91 
 
 		 205 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  52.38 
 
 		 210 aa  222  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  50.97 
 
 		 205 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  48.8 
 
 		 282 aa  197  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  48.33 
 
 		 208 aa  197  9e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  47.14 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  39.41 
 
 		 204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  36.95 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  35.12 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  34.47 
 
 		 206 aa  137  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  34.15 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  34.78 
 
 		 205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  37.26 
 
 		 209 aa  134  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  33.82 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  33.82 
 
 		 205 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  35.41 
 
 		 211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  34.93 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  35.98 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  33.65 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  31.25 
 
 		 210 aa  124  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  34.47 
 
 		 213 aa  124  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  34.95 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  34.93 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  30.24 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  36.84 
 
 		 212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  32.68 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  32.7 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  32.68 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  32.86 
 
 		 209 aa  114  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  32.52 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  33.97 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  31.88 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  33.5 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  31.9 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  31.25 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  31.71 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  32.7 
 
 		 211 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  31.22 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  31.03 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  31.92 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  29.05 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  31.19 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1747  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0430129 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  29.86 
 
 		 212 aa  97.8  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  29.38 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  29.86 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  29.86 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  32.49 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  30.28 
 
 		 215 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  29.25 
 
 		 211 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  28.5 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 		 214 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5473  protein of unknown function DUF47  30.92 
 
 		 213 aa  95.5  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.400135 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  29.82 
 
 		 215 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  29.38 
 
 		 215 aa  94.7  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  29.9 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  29.44 
 
 		 204 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  29.9 
 
 		 206 aa  94.4  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  30.81 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  30.73 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5203  protein of unknown function DUF47  31.73 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  25.12 
 
 		 208 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  26.83 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  30.33 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  31.75 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3394  hypothetical protein  31.1 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  25.49 
 
 		 207 aa  91.3  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000863551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  27.67 
 
 		 206 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  28.9 
 
 		 215 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  26.96 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  31.4 
 
 		 390 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5971  hypothetical protein  30.33 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  29.13 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0776  hypothetical protein  30.77 
 
 		 213 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.116713 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3162  hypothetical protein  29.86 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2334  hypothetical protein  29.13 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.590464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2947  hypothetical protein  28.16 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.847202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2522  protein of unknown function DUF47  29.13 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  27.98 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>