22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0868 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0868  metallophosphoesterase  100 
 
 
544 aa  1053    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00146692  normal  0.154808 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11330  predicted phosphohydrolase  42.54 
 
 
537 aa  311  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513687  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1223  metallophosphoesterase  42.71 
 
 
546 aa  295  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.148562  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9057  hypothetical protein  38.78 
 
 
499 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3363  metallophosphoesterase  34.92 
 
 
532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1115  metallophosphoesterase  39.49 
 
 
526 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190762  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2852  putative integral membrane protein  38.14 
 
 
537 aa  279  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4738  metallophosphoesterase  40.67 
 
 
513 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.203482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0545  metallophosphoesterase  37.14 
 
 
544 aa  268  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4366  metallophosphoesterase  35.31 
 
 
489 aa  259  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4458  metallophosphoesterase  36.09 
 
 
514 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1242  metallophosphoesterase  29.36 
 
 
499 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.163167  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1472  metallophosphoesterase  27.13 
 
 
466 aa  150  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.114222  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2226  hypothetical protein  27.75 
 
 
489 aa  135  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13180  hypothetical protein  34.98 
 
 
635 aa  81.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0785963  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1715  metallophosphoesterase  32.02 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.942049  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2227  metallophosphoesterase  34.83 
 
 
699 aa  74.7  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1571  metallophosphoesterase  30.93 
 
 
645 aa  60.8  0.00000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2238  metallophosphoesterase  36.26 
 
 
663 aa  58.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.771781  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1285  metallophosphoesterase  30 
 
 
474 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.645339  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4019  metallophosphoesterase  31.22 
 
 
480 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0504  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
281 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0551337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>