54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0823 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  100 
 
 		 307 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  71.38 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  64.45 
 
 		 322 aa  322  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  51.41 
 
 		 301 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  44.64 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2910  PRC-barrel domain protein  43.8 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  38.97 
 
 		 273 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1466  Domain of unknown function DUF2382  36.49 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0432048  normal  0.448786 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  39.58 
 
 		 283 aa  152  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  53.47 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  36.75 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  35.02 
 
 		 248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0050  Domain of unknown function DUF2382-like protein  35.71 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  45.79 
 
 		 380 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  38.93 
 
 		 158 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000024905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5727  PRC-barrel domain protein  38.61 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.310207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  27.18 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  36.27 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  35.35 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1547  hypothetical protein  38.6 
 
 		 246 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0888  PRC-barrel domain protein  31.3 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  32.99 
 
 		 142 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1236  hypothetical protein  37.08 
 
 		 120 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.325469  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1768  PRC-barrel domain-containing protein  32.38 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  26.4 
 
 		 311 aa  48.9  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0824  hypothetical protein  38.18 
 
 		 117 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1690  PRC-barrel domain-containing protein  32.08 
 
 		 156 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 		 160 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  34.31 
 
 		 258 aa  47  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3189  hypothetical protein  35.96 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 		 160 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0924  PRC-barrel domain protein  35.05 
 
 		 119 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  32.23 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5464  PRC-barrel domain-containing protein  30.84 
 
 		 161 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381239 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4240  PRC-barrel domain-containing protein  31.78 
 
 		 166 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3384  hypothetical protein  36.28 
 
 		 233 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0251  hypothetical protein  31.11 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.507454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3305  hypothetical protein  35.09 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  31.58 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  28 
 
 		 243 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5569  PRC-barrel domain-containing protein  31 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5293  PRC-barrel domain-containing protein  31.19 
 
 		 169 aa  43.5  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.15156 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5289  PRC-barrel  31 
 
 		 142 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.928377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5446  PRC-barrel domain protein  29.91 
 
 		 175 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.956105 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3986  PRC-barrel  30.91 
 
 		 163 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766762  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4381  PRC-barrel domain-containing protein  30.91 
 
 		 163 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0206882  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 		 163 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 		 163 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  29.91 
 
 		 163 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1359  PRC-barrel  28.04 
 
 		 160 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.73253  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6059  PRC-barrel domain-containing protein  28.04 
 
 		 160 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3285  PRC-barrel domain-containing protein  29.55 
 
 		 131 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6470  PRC-barrel domain-containing protein  28.04 
 
 		 160 aa  42.7  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00723922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0172  hypothetical protein  25.95 
 
 		 561 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0383324  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>