17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0817 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0817  membrane protein-like  100 
 
 		 384 aa  738    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  40.52 
 
 		 392 aa  190  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 372 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  33.57 
 
 		 373 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3804  hypothetical protein  34.04 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  30 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  30.05 
 
 		 431 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  25.43 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  28.89 
 
 		 378 aa  53.1  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  26.26 
 
 		 371 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  28.99 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  24.44 
 
 		 415 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  30.25 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  35.23 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  24.89 
 
 		 365 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  31.28 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  29.52 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>