82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0796 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0796  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 177 aa  347  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4929  isochorismatase hydrolase  51.14 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06910  nicotinamidase-like amidase  50.28 
 
 		 215 aa  166  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30640  nicotinamidase-like amidase  50 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0292  isochorismatase family protein  39.89 
 
 		 185 aa  140  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2989  isochorismatase hydrolase  32.8 
 
 		 192 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4310  isochorismatase hydrolase  31.85 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1636  isochorismatase hydrolase  30.64 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.26206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2986  isochorismatase hydrolase  32.78 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7116  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.902933  normal  0.0479285 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2663  isochorismatase hydrolase  34.81 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0767391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3825  isochorismatase hydrolase  32.22 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4483  isochorismatase hydrolase  32.73 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0763  isochorismatase hydrolase  34.71 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2408  isochorismatase hydrolase  31.95 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.796246  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2805  isochorismatase hydrolase  31.87 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1015  isochorismatase hydrolase  35.4 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0062  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6438  isochorismatase hydrolase  30.72 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00665606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1758  isochorismatase hydrolase  28.81 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1327  isochorismatase hydrolase  34.15 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.240514 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  34.05 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3974  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42350  Isochorismatase hydrolase  40.54 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1277  isochorismatase hydrolase  36.67 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3140  isochorismatase hydrolase  27.44 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5472  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 217 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.676342  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  35.14 
 
 		 172 aa  48.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  33.64 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  35 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2336  isochorismatase hydrolase  34.67 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3109  isochorismatase hydrolase  31.62 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456789  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1181  isochorismatase hydrolase  34.23 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.35365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0759  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.784211  normal  0.381442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1916  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  45.1 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2101  isochorismatase hydrolase  31.44 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.682407  normal  0.139759 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6032  isochorismatase hydrolase  27.61 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  35.34 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  24.39 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0467  isochorismatase family protein  39.68 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  27.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  27.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  27.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  27.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  27.84 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0048  isochorismatase hydrolase  29.52 
 
 		 210 aa  44.3  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2225  isochorismatase hydrolase  31.37 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19915  normal  0.0825967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  26.7 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  43.4 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1920  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0186  hypothetical protein  35.23 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348065  normal  0.468061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1993  isochorismatase hydrolase  40.98 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  36.36 
 
 		 217 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.77 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  26.67 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1997  isochorismatase hydrolase  32.56 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1215  isochorismatase family protein  28.71 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00883088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0322  isochorismatase hydrolase  40.38 
 
 		 221 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0166025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  26.67 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1005  isochorismatase family protein  38.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  28.25 
 
 		 220 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  25.71 
 
 		 227 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1739  isochorismatase hydrolase  28.11 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00170664  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06631  isochorismatase hydrolase family protein  36 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2732  isochorismatase family protein  38.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1678  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 217 aa  42  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06921  isochorismatase hydrolase family protein  30 
 
 		 188 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.467338  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0876  isochorismatase hydrolase  26.47 
 
 		 186 aa  42  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000128684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4344  isochorismatase hydrolase  36.56 
 
 		 235 aa  42  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.270913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  32.26 
 
 		 239 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  28.27 
 
 		 187 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0521  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.592648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1042  nicotinamidase  28.92 
 
 		 206 aa  41.2  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.794857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1914  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 		 203 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2374  isochorismatase hydrolase  34.09 
 
 		 217 aa  41.2  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0229134  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  29.14 
 
 		 190 aa  41.2  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2374  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.17 
 
 		 201 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.14 
 
 		 227 aa  40.8  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>