98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0777 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
130 aa  254  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0574046  hitchhiker  0.00140169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3741  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  60 
 
 
133 aa  130  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217317  normal  0.012325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0097  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.09 
 
 
155 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0115417  normal  0.062689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1581  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0308365  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4348  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  52.22 
 
 
119 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00391365  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3278  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36 
 
 
775 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3955  ATP-binding region ATPase domain protein  39.84 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.98 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2031  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.5 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4276  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.29 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0915518  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  38.02 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.32 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  36.29 
 
 
855 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
129 aa  60.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  37.39 
 
 
281 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4668  ATP-binding region ATPase domain protein  39.67 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2138  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  38.78 
 
 
155 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0220396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 
355 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1919  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.32 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40.45 
 
 
579 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
713 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
1039 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.44 
 
 
616 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  38.95 
 
 
365 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32040  histidine kinase  36.45 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.302354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
716 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  53.85 
 
 
754 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  53.85 
 
 
744 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0121  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 
470 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.660456  normal  0.370084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8758  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
192 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  32.82 
 
 
722 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  51.92 
 
 
743 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.05 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  30.67 
 
 
753 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.39 
 
 
146 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0207  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.87 
 
 
613 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.4 
 
 
738 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3782  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.88 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0156  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.888783  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3501  putative PAS/PAC sensor protein  37.74 
 
 
1225 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.480314  normal  0.404449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2744  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.05 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.813583  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 
776 aa  50.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  32.22 
 
 
591 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  49.12 
 
 
765 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  33.88 
 
 
745 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.4 
 
 
817 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7179  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.51 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0359047  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35220  PAS domain S-box  33.59 
 
 
771 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.5 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  36.36 
 
 
573 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2297  hypothetical protein  36.21 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000200107  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0918  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.56 
 
 
142 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283269  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
135 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5093  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.738847  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4050  serine phosphatase  41.05 
 
 
766 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  31.36 
 
 
746 aa  46.2  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2700  putative signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.738661  normal  0.546363 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6631  putative signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0674873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1921  hypothetical protein  37.76 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2800  putative signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
135 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366639  normal  0.788147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.33 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  33.7 
 
 
697 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7826  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4122  Stage II sporulation E family protein  31.4 
 
 
805 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.530219  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  36.08 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0400  putative signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.26 
 
 
1045 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3236  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4491  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.8 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0305  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 
184 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.285434 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  39 
 
 
200 aa  43.5  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1306  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
202 aa  42.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00486516  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  36 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8367  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 
211 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0038  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.536506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  38.64 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3638  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 
693 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.718947  normal  0.379759 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.78 
 
 
549 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4524  protein serine/threonine phosphatase  31.96 
 
 
693 aa  41.2  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  34.94 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 
1432 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1779  putative signal transduction histidine kinase  33 
 
 
214 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.144417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8468  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.17 
 
 
245 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.319959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.51 
 
 
750 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0665  protein serine/threonine phosphatase  32.87 
 
 
800 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6464  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.31 
 
 
164 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.675812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1052  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.7 
 
 
655 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.620454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>