More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0728 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
336 aa  626  1e-178  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.57 
 
 
390 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  41.45 
 
 
350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  45.31 
 
 
397 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
360 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 
389 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 
400 aa  176  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  40.55 
 
 
423 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 
421 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  44.41 
 
 
304 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  42.57 
 
 
366 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 
369 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 
369 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 
369 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
373 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.73 
 
 
330 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
362 aa  152  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  37.54 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  36.12 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  35.84 
 
 
362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  37.95 
 
 
364 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 
364 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  36.97 
 
 
349 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  38.17 
 
 
300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.77 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.12 
 
 
347 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  35.02 
 
 
352 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 
333 aa  105  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  35.74 
 
 
312 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
297 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.34 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
265 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  31.1 
 
 
299 aa  86.7  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
264 aa  85.9  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.97 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  34.08 
 
 
261 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.97 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  33.11 
 
 
282 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.97 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 
263 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  29.56 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.11 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  45.65 
 
 
301 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  30.99 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1465  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
289 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.647363  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.99 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.95 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.95 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.95 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  30.74 
 
 
261 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
317 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  31.51 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.89 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  29.9 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  34.16 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.67 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  34.48 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  31.2 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  31.38 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  30.58 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.43 
 
 
263 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  30.21 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  30.51 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  30.88 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.29 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1330  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.515623  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 
261 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>