More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0727 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0727  alanine racemase  100 
 
 		 415 aa  783    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00288843  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  56.27 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  55.41 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  55.59 
 
 		 372 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4247  alanine racemase  55.59 
 
 		 372 aa  360  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170203  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  54.93 
 
 		 371 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  54.62 
 
 		 381 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0627  alanine racemase  50.65 
 
 		 410 aa  351  2e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00334248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2606  alanine racemase  55.73 
 
 		 374 aa  347  2e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  54.35 
 
 		 376 aa  347  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  52.69 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  53.51 
 
 		 397 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29250  alanine racemase  55.14 
 
 		 412 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0900  alanine racemase  52.11 
 
 		 378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  54.42 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3073  alanine racemase  55.32 
 
 		 378 aa  336  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.235998  normal  0.409872 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  50.26 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2600  alanine racemase  54.64 
 
 		 410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  49.75 
 
 		 437 aa  325  7e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000945338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4462  alanine racemase  57.56 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1190  alanine racemase  55.09 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.964893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0673  alanine racemase  51.24 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  49.61 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  47.53 
 
 		 408 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  48.11 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1173  alanine racemase  46.26 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1146  alanine racemase  46.26 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1163  alanine racemase  46.26 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.434451 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07450  alanine racemase  50.65 
 
 		 391 aa  293  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.764543  normal  0.0936782 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04590  alanine racemase  49.18 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.379563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1108  alanine racemase  47.34 
 
 		 402 aa  280  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440302  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4934  alanine racemase  46.67 
 
 		 383 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1052  alanine racemase  41.56 
 
 		 459 aa  270  4e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1484  alanine racemase  47 
 
 		 390 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.159297  normal  0.789222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0559  alanine racemase  46.81 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  36.27 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1711  alanine racemase  46.6 
 
 		 381 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.169003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0878  alanine racemase  46.13 
 
 		 380 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  40.43 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0906  slanine racemase  41.99 
 
 		 450 aa  241  1e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.431775  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16720  alanine racemase  45.95 
 
 		 401 aa  240  4e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.872897  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  32.18 
 
 		 373 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  37.37 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  37.93 
 
 		 371 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3485  alanine racemase  43.5 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  32.71 
 
 		 373 aa  227  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  31.43 
 
 		 380 aa  226  6e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23160  alanine racemase  43.59 
 
 		 390 aa  226  8e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334874  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  37.14 
 
 		 373 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  32.45 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  36.51 
 
 		 403 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  36.98 
 
 		 851 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  40.21 
 
 		 369 aa  220  5e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  39.9 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  39.03 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  39.15 
 
 		 406 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  33.78 
 
 		 398 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  38.36 
 
 		 373 aa  213  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  33.42 
 
 		 392 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  33.42 
 
 		 379 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  34.58 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  35.98 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  36.24 
 
 		 403 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  35.25 
 
 		 395 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  37.96 
 
 		 390 aa  209  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  32.37 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  30.65 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  33.15 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  38.16 
 
 		 441 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  33.16 
 
 		 390 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  32.1 
 
 		 364 aa  207  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  33.33 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  33.16 
 
 		 386 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0532  alanine racemase  42.08 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00790178  hitchhiker  0.0000218337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  31.85 
 
 		 389 aa  206  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  33.15 
 
 		 391 aa  206  9e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  33.16 
 
 		 386 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  35.34 
 
 		 395 aa  205  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  35.19 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  32.88 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  32.61 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  39.74 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  32.61 
 
 		 391 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  34.75 
 
 		 370 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  32.35 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  30.03 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  34.92 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  32.61 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  34.92 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  37.2 
 
 		 376 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  34.92 
 
 		 389 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  32.61 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  34.92 
 
 		 389 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  33.42 
 
 		 408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  34.92 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  34.92 
 
 		 389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  32.61 
 
 		 391 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  34.13 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  34.76 
 
 		 387 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  30.03 
 
 		 388 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>