More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0683 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1116  30S ribosomal protein S7  85.26 
 
 
156 aa  288  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  86.54 
 
 
156 aa  283  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  86.54 
 
 
156 aa  282  1e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6618  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 
156 aa  281  3e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29800  SSU ribosomal protein S7P  83.97 
 
 
156 aa  279  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4511  ribosomal protein S7  83.97 
 
 
156 aa  278  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10697  30S ribosomal protein S7  86.54 
 
 
156 aa  278  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.786123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0922  ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  277  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0583  ribosomal protein S7  82.05 
 
 
156 aa  277  5e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.139613  normal  0.106054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2694  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  276  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.298478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  84.62 
 
 
156 aa  276  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3805  ribosomal protein S7  84.62 
 
 
156 aa  276  9e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59243  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2981  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  275  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0623  ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  275  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5120  ribosomal protein S7  82.05 
 
 
156 aa  275  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.455087 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23890  SSU ribosomal protein S7P  82.69 
 
 
156 aa  275  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0482978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  85.26 
 
 
156 aa  274  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6053  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  274  4e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  85.26 
 
 
156 aa  274  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  85.26 
 
 
156 aa  274  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17220  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  274  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0578  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  271  2e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  270  4e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4325  ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  270  5e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  83.33 
 
 
156 aa  270  5e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3927  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  270  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481009  normal  0.54181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4319  30S ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  270  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.571131  hitchhiker  0.0043079 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2650  30S ribosomal protein S7  80.77 
 
 
156 aa  268  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3924  30S ribosomal protein S7  82.69 
 
 
156 aa  267  3e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  81.41 
 
 
156 aa  266  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1082  30S ribosomal protein S7  78.21 
 
 
156 aa  262  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0302  30S ribosomal protein S7  77.56 
 
 
156 aa  258  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1181  30S ribosomal protein S7  77.56 
 
 
156 aa  256  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458532  normal  0.0579961 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0558  30S ribosomal protein S7  76.92 
 
 
156 aa  251  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378415  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1097  ribosomal protein S7  71.15 
 
 
156 aa  238  3e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0854  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 
156 aa  235  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.633412  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0394  ribosomal protein S7  67.31 
 
 
156 aa  218  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.633784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  217  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  64.74 
 
 
156 aa  215  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.92136e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  215  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  4.42376e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  214  5e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  9.00899e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  213  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.10678e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  2e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.84124e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1165  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  212  2e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.69779e-09  hitchhiker  5.90673e-07 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.19716e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.53509e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.71364e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.54226e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2159  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 
156 aa  211  3e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.134079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.01536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  211  3e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  210  5e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.31249e-15  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  210  5e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.1851e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  210  6e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.22737e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  1.47883e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  209  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  61.54 
 
 
156 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  8.92295e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  209  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  3.043e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  207  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.39374e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16270  SSU ribosomal protein S7P  61.54 
 
 
156 aa  208  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  1.89839e-05  hitchhiker  4.25179e-05 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  208  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  207  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.88797e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  206  7e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  4.72522e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  206  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.07065e-08  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  61.15 
 
 
157 aa  206  1e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  4.12886e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 
156 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  3.27115e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  204  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.50114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
156 aa  204  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.52337e-15 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  204  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  204  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  6.56375e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0959  ribosomal protein S7  60.26 
 
 
156 aa  204  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  1.5006e-06  hitchhiker  1.43074e-10 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  62.18 
 
 
156 aa  204  4e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10050  SSU ribosomal protein S7P  59.62 
 
 
156 aa  204  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  2.94086e-07  hitchhiker  1.01858e-09 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  204  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  204  5e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
155 aa  203  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0221  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  203  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  4.4788e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  202  1e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
155 aa  202  1e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
155 aa  202  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  58.97 
 
 
156 aa  201  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  7.41191e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  5.71074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  199  1e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  5.34832e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  199  1e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.12284e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  198  2e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  61.73 
 
 
162 aa  198  2e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  56.41 
 
 
156 aa  198  2e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  5.4268e-11  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  57.69 
 
 
156 aa  197  4e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  57.05 
 
 
156 aa  197  4e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  197  4e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  197  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  196  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.33 
 
 
156 aa  196  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.3208e-06  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  60.9 
 
 
156 aa  196  1e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.78965e-06  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  55.77 
 
 
156 aa  196  1e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  195  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0356  ribosomal protein S7  57.42 
 
 
156 aa  195  2e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  1.14638e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>