More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0677 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  100 
 
 		 238 aa  475  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  79.74 
 
 		 238 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  79.66 
 
 		 238 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  78.72 
 
 		 238 aa  380  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  79.74 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  81.36 
 
 		 238 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  76.96 
 
 		 235 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  75.64 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  78.06 
 
 		 237 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  76.39 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  76.07 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  76.5 
 
 		 237 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  73.08 
 
 		 237 aa  358  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  75.45 
 
 		 225 aa  357  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  72.29 
 
 		 238 aa  353  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  70.13 
 
 		 238 aa  348  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  74.89 
 
 		 235 aa  347  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  75.22 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  74.89 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  75.22 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  75.22 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  73.84 
 
 		 239 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  75.11 
 
 		 235 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  72.57 
 
 		 259 aa  341  5.999999999999999e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  74.03 
 
 		 239 aa  338  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  72.05 
 
 		 239 aa  338  5.9999999999999996e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  72.15 
 
 		 237 aa  337  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  73.53 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  69.57 
 
 		 236 aa  332  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  73.21 
 
 		 230 aa  333  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  73.04 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  73.82 
 
 		 239 aa  332  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  73.82 
 
 		 239 aa  327  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  73.16 
 
 		 237 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  69.03 
 
 		 230 aa  317  1e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  69.64 
 
 		 238 aa  315  5e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  63.91 
 
 		 235 aa  313  1.9999999999999998e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  73.58 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  67.26 
 
 		 231 aa  305  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  59.82 
 
 		 231 aa  285  5e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  57.21 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  59.39 
 
 		 238 aa  281  8.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  60.61 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  58.95 
 
 		 236 aa  276  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  58.74 
 
 		 230 aa  276  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 231 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  59.64 
 
 		 229 aa  268  4e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  55.86 
 
 		 233 aa  268  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  54.27 
 
 		 242 aa  267  8.999999999999999e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  56.64 
 
 		 230 aa  267  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 233 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  57.14 
 
 		 233 aa  266  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 235 aa  265  5e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  59.11 
 
 		 233 aa  264  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  60.09 
 
 		 230 aa  261  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  51.74 
 
 		 235 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  59.64 
 
 		 230 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1822  50S ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 232 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.122687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  53.02 
 
 		 231 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  57.08 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  52.42 
 
 		 233 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  54.08 
 
 		 242 aa  258  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0098  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000678721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0094  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.15488e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  55.8 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0092  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000339498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0098  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000205875  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  54.91 
 
 		 226 aa  257  1e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0128  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000143327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  59.19 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0093  50S ribosomal protein L1  59.64 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000014838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  55.22 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0975  50S ribosomal protein L1  55.36 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0199586 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  54.46 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.22 
 
 		 232 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1475  50S ribosomal protein L1  54.51 
 
 		 237 aa  251  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0729357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2564  50S ribosomal protein L1  54.26 
 
 		 232 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0511824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1519  50S ribosomal protein L1  58.22 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00056705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0123  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 237 aa  251  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.991337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  54.34 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 232 aa  251  8.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  52.63 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  56.25 
 
 		 233 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3865  50S ribosomal protein L1  57.33 
 
 		 231 aa  250  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.100026 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  49.12 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1419  50S ribosomal protein L1  57.01 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560035  normal  0.451837 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  54.74 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  54.87 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  53.04 
 
 		 232 aa  247  9e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0564  50S ribosomal protein L1  54.31 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1633  50S ribosomal protein L1  54.78 
 
 		 235 aa  247  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858056  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1820  50S ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 231 aa  247  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.186672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>