274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0670 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0670  adenosine deaminase  100 
 
 		 358 aa  701    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000235929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29960  adenosine deaminase  68.04 
 
 		 384 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.540626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21160  adenosine deaminase  69.55 
 
 		 349 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2686  adenosine deaminase  71.3 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.806346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3173  adenosine deaminase  65.79 
 
 		 378 aa  415  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0278183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0605  adenosine deaminase  69.94 
 
 		 340 aa  413  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.624245  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4359  adenosine deaminase  63.03 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0572  adenosine deaminase  64.6 
 
 		 355 aa  388  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00357349 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0674  adenosine deaminase  62.24 
 
 		 343 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0226748  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24030  adenosine deaminase  62.8 
 
 		 343 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0534  adenosine deaminase  59.29 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479876  hitchhiker  0.00666941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2662  adenosine deaminase  59.29 
 
 		 342 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5106  adenosine deaminase  58.02 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582125  normal  0.494241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1064  Adenosine deaminase  55.07 
 
 		 350 aa  338  5.9999999999999996e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4085  adenosine deaminase  46.73 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0629  adenosine deaminase  43.11 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1299  adenosine deaminase  41.76 
 
 		 325 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4458  adenosine deaminase  40.06 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  29.09 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  35.4 
 
 		 337 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.54 
 
 		 326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0278  adenosine deaminase  33.44 
 
 		 327 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3659  adenosine deaminase  35.28 
 
 		 325 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  33.63 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4180  adenosine deaminase  33.23 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6019  adenosine deaminase  35.69 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.885255  normal  0.53163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4468  adenosine deaminase  32.42 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0771279  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  33.44 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  33.44 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  31.38 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1355  adenosine deaminase  34.21 
 
 		 348 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.630896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  33.91 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2984  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 325 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208704  normal  0.261493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  34.2 
 
 		 340 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1459  adenosine deaminase  37.43 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.333646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  32.02 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  29.82 
 
 		 354 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3344  adenosine deaminase  34.19 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2196  adenosine deaminase  34.52 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0230  adenosine deaminase  32.07 
 
 		 332 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.278502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4607  adenosine deaminase  33.72 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.482782 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  30.03 
 
 		 345 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  30.03 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  31.02 
 
 		 345 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3645  adenosine deaminase  35.01 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  29.91 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  30.56 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  36.73 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  30 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  31.91 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2797  adenosine deaminase  30.29 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000659545  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  32.63 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  26.53 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  30.29 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  30.29 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0105  adenosine deaminase  30.23 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  27.33 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  29.2 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3627  adenosine deaminase  29.7 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  30.43 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2220  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.679535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0100  adenosine deaminase  29.15 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  26.84 
 
 		 346 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0116  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  33.63 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  31.52 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4731  adenosine deaminase  28.57 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0098  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  30.72 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  29.97 
 
 		 341 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0048  adenosine deaminase  27.81 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  29.94 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  29.77 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4117  adenosine deaminase  27.71 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3721  adenosine deaminase  29.57 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  28.74 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  30.7 
 
 		 346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  28.49 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  31.74 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  28.49 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  28.61 
 
 		 682 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  28.61 
 
 		 682 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0041  adenosine deaminase  27.27 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  26.65 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  27.95 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  32.34 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1811  adenosine deaminase  28.15 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0085  adenosine deaminase  28.53 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.18641 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  29.01 
 
 		 341 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  28.41 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  28.82 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3912  adenosine deaminase  27.41 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0265646 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3914  adenosine deaminase  27.41 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  28.49 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  26.3 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  28.44 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  27.99 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1831  adenosine deaminase  28.15 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4004  adenosine deaminase  27.66 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1573  adenosine deaminase  28.91 
 
 		 333 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  normal  0.320596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>