217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0666 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0666  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 409 aa  761    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0347459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1769  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 388 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.632189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2537  major facilitator transporter  51.1 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274022  normal  0.434493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2534  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.441567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0602  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 		 413 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.101866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3179  major facilitator superfamily MFS_1  52.06 
 
 		 413 aa  283  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0130031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2714  major facilitator transporter  52.42 
 
 		 404 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.773773  hitchhiker  0.00188089 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4261  major facilitator superfamily MFS_1  40.25 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.426527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3874  major facilitator superfamily MFS_1  55.52 
 
 		 397 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.369996  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3025  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4139  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 400 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.896136  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3060  major facilitator superfamily MFS_1  45.23 
 
 		 402 aa  239  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.154269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2780  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 		 395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2689  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 433 aa  235  9e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0566  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 425 aa  232  8.000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2737  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00369572 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00812  predicted transporter  39.24 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.490752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2797  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.354207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3917  major facilitator superfamily MFS_1  46.02 
 
 		 397 aa  229  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00829  hypothetical protein  39.24 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.48628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0872  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0917  major facilitator transporter  39.24 
 
 		 402 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0998  transporter, major facilitator family  39.24 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.207413 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0907  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.379242  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2500  transporter, major facilitator family  39.24 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4303  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 433 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.530625  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3180  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 446 aa  220  3.9999999999999997e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0150137 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3706  major facilitator superfamily transporter  36.41 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2797  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.569839  normal  0.408376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2690  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3079  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0284057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1336  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18420  fucose permease  40.51 
 
 		 414 aa  213  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.29199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0904  inner membrane protein YbjJ  38.92 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1001  hypothetical protein  38.92 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.705543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0940  inner membrane protein YbjJ  39.89 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0972  inner membrane protein YbjJ  39.89 
 
 		 403 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.929819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1020  inner membrane protein YbjJ  38.92 
 
 		 403 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1875  hypothetical protein  34.97 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0049  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 480 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.200181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2374  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2088  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31500  fucose permease  39.35 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07710  Major Facilitator Superfamily transporter  34.56 
 
 		 502 aa  203  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.18857  normal  0.036031 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3154  hypothetical protein  33.85 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000811574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3401  hypothetical protein  33.85 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0773641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3376  hypothetical protein  34.01 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3724  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.830199  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0565  major facilitator superfamily MFS_1  39.4 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.308939  normal  0.0136421 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2654  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 391 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0704  integral membrane protein  40 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.64582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1165  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104586 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0923  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3134  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2464  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.163506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3330  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1121  major facilitator transporter  31.04 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1047  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0461  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 381 aa  139  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1715  putative transporter  30.79 
 
 		 397 aa  139  8.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6975  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1167  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 405 aa  136  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1512  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6317  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 385 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.384124 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30800  fucose permease  35 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3048  sugar (and other) transporter, C-terminal region  41.82 
 
 		 182 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00412524  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4331  MFS permease  30.91 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.611947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  32.77 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2244  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2285  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0840  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 405 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3086  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 391 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.269541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3265  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 384 aa  129  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1499  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 379 aa  129  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.276684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4432  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669065 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3174  major facilitator superfamily transporter  33.24 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.273368  normal  0.04307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5723  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3832  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1509  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1853  putative transporter  32.89 
 
 		 417 aa  126  7e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117056  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2920  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 382 aa  126  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146582 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4705  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00787464  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4160  major facilitator superfamily MFS_1  32.4 
 
 		 396 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0289  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 408 aa  123  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580244  normal  0.107939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18660  hypothetical protein  32.61 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3423  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1615  hypothetical protein  32.31 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2159  major facilitator superfamily MFS_1  29.75 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0853792  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2868  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5020  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  0.118195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2912  major facilitator superfamily transporter  32.54 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2898  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.681989 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1552  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2808  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.794185  normal  0.146653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2151  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 388 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000894415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4432  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1070  putative transporter  32.71 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.44302  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0062  putative transporter  32.71 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0357  putative transporter  32.71 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39371  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1647  major facilitator family transporter  32.71 
 
 		 378 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>