242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0589 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0589  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 452 aa  907    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.289831  normal  0.0417818 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  34.34 
 
 		 427 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  34.59 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  31.6 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.25 
 
 		 450 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  31.57 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3578  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2081  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 		 434 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159947  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  31.53 
 
 		 441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4006  extracellular solute-binding protein family 1  31.46 
 
 		 428 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0806  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4335  extracellular solute-binding protein family 1  30.24 
 
 		 428 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 453 aa  178  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1702  sugar-binding protein  28.7 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.981171  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3124  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0621948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0793  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 		 442 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.15 
 
 		 434 aa  172  9e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2460  extracellular solute-binding protein family 1  29.98 
 
 		 441 aa  172  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.372805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 432 aa  170  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3324  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 427 aa  167  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000420771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 450 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1049  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.340866 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  29.54 
 
 		 446 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 422 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  29.93 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.82 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.57 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2228  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 460 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.754729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3557  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 458 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1534  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 436 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.191711  decreased coverage  0.00957964 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3899  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29740  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.94 
 
 		 437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3402  extracellular solute-binding protein  24.89 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000236647  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0697  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2376  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4051  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4040  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 434 aa  97.1  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1904  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.172949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2144  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2197  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.700843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2102  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2395  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 451 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3784  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2037  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 430 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0558  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 444 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1966  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3292  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.309737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4050  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1688  oligogalacturonide ABC transporter, periplasmic oligogalacturonide-binding protein  23.72 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0550228  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1798  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 		 430 aa  83.2  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.763472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2648  oligogalacturonide ABC transporter periplasmic oligogalacturonide-binding protein  23.72 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.316005  normal  0.159215 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0619  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000037115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0777  extracellular solute-binding protein  19.91 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.09 
 
 		 453 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 422 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.22 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.21 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.39 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.39 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.4 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.95 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  21.04 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.45 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3369  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3527  extracellular solute-binding protein family 1  32.17 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31.91 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 466 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4716  extracellular solute-binding protein family 1  29.02 
 
 		 432 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  23.48 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.24 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>