More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0552 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  100 
 
 		 319 aa  644    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  56.36 
 
 		 299 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  50.33 
 
 		 300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  53.95 
 
 		 300 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  50.33 
 
 		 300 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  51.68 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  49.33 
 
 		 307 aa  292  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  55.48 
 
 		 313 aa  289  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  51.57 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  53.33 
 
 		 306 aa  278  9e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  50.86 
 
 		 296 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  44.03 
 
 		 305 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  39.38 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  36.81 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  40.14 
 
 		 287 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  39.42 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  36.63 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  33.68 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  38.77 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  36.4 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  30.87 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  33.33 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  30.2 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  32.2 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  30.15 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  29.79 
 
 		 346 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  28.09 
 
 		 339 aa  125  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  28.26 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  29.5 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  29.45 
 
 		 304 aa  119  6e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  30.23 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  27.21 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  32.73 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  29.96 
 
 		 303 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  26.5 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  25.35 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  21.74 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  25.63 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1064  tricorn interacting factor F1  22.95 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  28.52 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  21.32 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.45 
 
 		 270 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  27.57 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00763  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.59 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.54 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5137  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  32.16 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.72 
 
 		 282 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4841  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  27.08 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  26.94 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.04 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.89 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  27.17 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.59 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 261 aa  68.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  27.41 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  23.78 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  28.95 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.7 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  25.2 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.18 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0373  proline iminopeptidase  29.43 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0825  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210613  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.41 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.16 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.16 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  30.04 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0689  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574556  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5059  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1876  proline iminopeptidase  28.72 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756215  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0279  proline iminopeptidase  28.72 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 296 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2151  proline iminopeptidase  28.72 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  28.36 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0886  proline iminopeptidase  28.72 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1173  proline iminopeptidase  28.72 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  28.83 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.62 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.62 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1797  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.287372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>