216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0541 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0541  dihydroneopterin aldolase  100 
 
 
137 aa  260  5e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.224084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9171  Dihydroneopterin aldolase  62.71 
 
 
120 aa  137  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2984  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  60.77 
 
 
612 aa  137  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.261755  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32060  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  56.69 
 
 
1211 aa  131  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01270  dihydroneopterin aldolase  59.32 
 
 
126 aa  131  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2891  dihydroneopterin aldolase  59.66 
 
 
126 aa  131  4e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0630  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  59.06 
 
 
525 aa  130  8e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00284446  normal  0.33156 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0169  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  58.82 
 
 
337 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0060964  normal  0.143037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0154  dihydroneopterin aldolase  53.78 
 
 
119 aa  124  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4501  dihydroneopterin aldolase  59.66 
 
 
124 aa  123  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2101  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  55.08 
 
 
841 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0317  dihydroneopterin aldolase  52.5 
 
 
135 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8421  dihydroneopterin aldolase  48.03 
 
 
147 aa  120  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4406  dihydroneopterin aldolase  56.3 
 
 
155 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.114139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6217  dihydroneopterin aldolase  55.93 
 
 
123 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4974  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  55.93 
 
 
310 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.21423  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4731  dihydroneopterin aldolase  55.46 
 
 
120 aa  117  8e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0109626  decreased coverage  2.15916e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0316  dihydroneopterin aldolase  50.85 
 
 
125 aa  113  1e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.17709  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0705  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridin epyrophosphokinase  58.33 
 
 
372 aa  112  1e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.912553  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4296  dihydroneopterin aldolase  54.7 
 
 
120 aa  112  1e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.505209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0562  dihydroneopterin aldolase  51.69 
 
 
127 aa  112  2e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35620  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
130 aa  111  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.192701  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1852  dihydroneopterin aldolase  50.42 
 
 
470 aa  110  7e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5153  dihydroneopterin aldolase  51.69 
 
 
123 aa  110  8e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4014  dihydroneopterin aldolase  54.24 
 
 
125 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0208  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.99 
 
 
333 aa  103  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0493459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4853  dihydroneopterin aldolase  50.44 
 
 
125 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4767  dihydroneopterin aldolase  50.44 
 
 
125 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0619  dihydroneopterin aldolase  56.67 
 
 
128 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0155  dihydroneopterin aldolase  40.83 
 
 
131 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3443  dihydroneopterin aldolase  57.81 
 
 
135 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.996393  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0447  dihydroneopterin aldolase  46.28 
 
 
128 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4785  dihydroneopterin aldolase  46.51 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0888028  normal  0.076763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24750  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  52.68 
 
 
295 aa  95.5  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13639  dihydroneopterin aldolase folB  47.37 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00551431  hitchhiker  0.00236264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5369  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040071 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3529  dihydroneopterin aldolase  45.76 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.959626  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1419  dihydroneopterin aldolase  48.31 
 
 
123 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.391018 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0152  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
122 aa  90.9  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.011872  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12830  dihydroneopterin aldolase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.06 
 
 
305 aa  90.1  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0897405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0851  dihydroneopterin aldolase  49.57 
 
 
131 aa  88.6  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0826  dihydroneopterin aldolase  43.33 
 
 
125 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0550  dihydroneopterin aldolase  39.66 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0537  dihydroneopterin aldolase  39.66 
 
 
121 aa  88.6  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0923688  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1765  dihydroneopterin aldolase  42.02 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0803324  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1764  dihydroneopterin aldolase  40.68 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.276601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1880  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  35.83 
 
 
276 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1277  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.32 
 
 
273 aa  85.1  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00023315  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0407  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.248739  decreased coverage  0.00598583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2579  dihydroneopterin aldolase  46 
 
 
126 aa  84.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1099  dihydroneopterin aldolase/ 2-amino-4-hydroxy-6-hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  39.32 
 
 
273 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00662254  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5982  dihydroneopterin aldolase  42.37 
 
 
122 aa  84  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2149  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
130 aa  82.8  1e-15  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.457154  normal  0.194696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1813  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
130 aa  82.4  2e-15  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.968446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3025  dihydroneopterin aldolase (DHNA)  39.83 
 
 
122 aa  82.8  2e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0154  dihydroneopterin aldolase  37.93 
 
 
121 aa  81.3  4e-15  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.867161  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2234  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
121 aa  80.9  5e-15  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2043  dihydroneopterin aldolase  38.66 
 
 
121 aa  80.9  6e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1931  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
125 aa  80.9  6e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.190594  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0965  dihydroneopterin aldolase  40.37 
 
 
128 aa  80.5  8e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.877647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0236  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
121 aa  80.1  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.965704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2634  dihydroneopterin aldolase  37.93 
 
 
121 aa  78.6  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0808161  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3534  dihydroneopterin aldolase  38.14 
 
 
125 aa  77.4  6e-14  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0920565  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2582  dihydroneopterin aldolase  36.54 
 
 
122 aa  76.3  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0084  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.5  2e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.940735  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1882  2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.53 
 
 
292 aa  75.9  2e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.586042  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2116  dihydroneopterin aldolase  39.22 
 
 
119 aa  76.3  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0071  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  75.1  3e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0072  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0081  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08398e-06 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0072  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0068  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0080  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
120 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.884777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0073  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
126 aa  73.6  9e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0921  dihydroneopterin aldolase  33.61 
 
 
119 aa  73.6  9e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.294269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5236  dihydroneopterin aldolase  32.5 
 
 
120 aa  72.8  1e-12  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.22875e-06 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0996  dihydroneopterin aldolase  36.27 
 
 
119 aa  72  2e-12  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1114  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
120 aa  72.4  2e-12  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1030  dihydroneopterin aldolase  36.27 
 
 
119 aa  72  2e-12  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.235973  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1230  dihydroneopterin aldolase  40.4 
 
 
127 aa  72.8  2e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0311  dihydroneopterin aldolase  36.97 
 
 
118 aa  71.6  3e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0512  dihydroneopterin aldolase  40.19 
 
 
125 aa  71.6  3e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27090  dihydroneopterin aldolase  32.77 
 
 
119 aa  72  3e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5757  dihydroneopterin aldolase  41.53 
 
 
126 aa  71.2  4e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.608732 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0397  dihydroneopterin aldolase  41.32 
 
 
124 aa  70.5  7e-12  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.294634  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0068  dihydroneopterin aldolase  30.25 
 
 
120 aa  68.2  3e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1499  dihydroneopterin aldolase  31.09 
 
 
119 aa  68.6  3e-11  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00115418  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0040  dihydroneopterin aldolase dihydroneopterin aldolase  31.93 
 
 
125 aa  68.6  3e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3225  dihydroneopterin aldolase family protein  32.77 
 
 
121 aa  68.2  4e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1533  dihydroneopterin aldolase  34.82 
 
 
123 aa  67.8  4e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.42318 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1413  dihydroneopterin aldolase  36.61 
 
 
119 aa  67  9e-11  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0116  dihydroneopterin aldolase  28.1 
 
 
117 aa  66.2  1e-10  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.26497e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2066  dihydroneopterin aldolase  28.1 
 
 
117 aa  65.5  3e-10  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000254048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0096  dihydroneopterin aldolase  38.98 
 
 
123 aa  62.4  2e-09  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1513  dihydroneopterin aldolase  38.05 
 
 
138 aa  62.8  2e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1291  dihydroneopterin aldolase  34.31 
 
 
116 aa  62.4  2e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2984  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
116 aa  61.6  3e-09  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00408374  normal  0.160574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2902  dihydroneopterin aldolase  33.33 
 
 
116 aa  61.6  3e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.33829e-08  normal  0.020478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>