More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0539 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0539  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.222886 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2103  GTP cyclohydrolase I  79.26 
 
 
200 aa  299  2e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2986  GTP cyclohydrolase I  73.5 
 
 
202 aa  289  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.472949  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8425  GTP cyclohydrolase I  74.24 
 
 
234 aa  287  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32080  GTP cyclohydrolase I  70.81 
 
 
219 aa  284  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0315  GTP cyclohydrolase I  75.96 
 
 
214 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  74.46 
 
 
193 aa  277  9e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01250  GTP cyclohydrolase I  71.79 
 
 
206 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0628  GTP cyclohydrolase I  74.46 
 
 
216 aa  275  3e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00907576  normal  0.596235 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  73.58 
 
 
207 aa  275  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  75.41 
 
 
206 aa  275  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0445  GTP cyclohydrolase I  69.65 
 
 
205 aa  273  1e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0152  GTP cyclohydrolase  73.22 
 
 
214 aa  273  2e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  75.54 
 
 
210 aa  272  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3446  GTP cyclohydrolase I  73.4 
 
 
194 aa  271  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0793851  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  74.05 
 
 
199 aa  270  8e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0703  GTP cyclohydrolase I  69.39 
 
 
200 aa  269  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.659577 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24770  GTP cyclohydrolase I  71.89 
 
 
195 aa  266  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5155  GTP cyclohydrolase I  72.28 
 
 
201 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.780248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4769  GTP cyclohydrolase I  72.28 
 
 
201 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4855  GTP cyclohydrolase I  72.28 
 
 
201 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0314  GTP cyclohydrolase I  75.41 
 
 
209 aa  264  6e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.974125  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  70.74 
 
 
214 aa  264  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5371  GTP cyclohydrolase I  71.74 
 
 
202 aa  263  9e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4016  GTP cyclohydrolase I  69.59 
 
 
219 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 
219 aa  262  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13641  GTP cyclohydrolase I  69.89 
 
 
202 aa  261  6e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  70.65 
 
 
198 aa  259  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1417  GTP cyclohydrolase I  69.57 
 
 
202 aa  258  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0939042  normal  0.395983 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  70.59 
 
 
200 aa  258  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35640  GTP cyclohydrolase I  72.97 
 
 
222 aa  258  5e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289677  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0297  GTP cyclohydrolase I  69.73 
 
 
257 aa  257  9e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  70.49 
 
 
219 aa  254  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0849  GTP cyclohydrolase I  64.73 
 
 
220 aa  254  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.989382  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1850  GTP cyclohydrolase I  69.57 
 
 
199 aa  251  5e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.892033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12810  GTP cyclohydrolase I  67.76 
 
 
188 aa  242  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1758  GTP cyclohydrolase I  65.59 
 
 
187 aa  241  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  65.59 
 
 
195 aa  240  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  65.24 
 
 
217 aa  240  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  66.67 
 
 
188 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  65.22 
 
 
194 aa  238  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  65.95 
 
 
190 aa  238  7e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  63.04 
 
 
198 aa  236  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_987  GTP cyclohydrolase I  58.92 
 
 
189 aa  234  7e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1204  GTP cyclohydrolase I  57.67 
 
 
189 aa  233  1e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1014  GTP cyclohydrolase I  58.38 
 
 
189 aa  232  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0121  GTP cyclohydrolase I  61.62 
 
 
189 aa  231  8e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.952569  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0748  GTP cyclohydrolase I  61 
 
 
227 aa  229  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  60.66 
 
 
187 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.28412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  60.66 
 
 
188 aa  224  5e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  6.76289e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  63.89 
 
 
188 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  60.11 
 
 
185 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1408  GTP cyclohydrolase I  61.08 
 
 
192 aa  221  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0190569  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2980  GTP cyclohydrolase I  59.56 
 
 
185 aa  220  1e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.39263e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.00048e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.62982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1605  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  61.75 
 
 
186 aa  219  2e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  61.11 
 
 
189 aa  219  2e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  61.67 
 
 
189 aa  218  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2817  GTP cyclohydrolase I  60.22 
 
 
206 aa  218  7e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2153  GTP cyclohydrolase I  62.22 
 
 
188 aa  216  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.14147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 
187 aa  215  3e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0624  GTP cyclohydrolase I  61.41 
 
 
195 aa  215  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  59.89 
 
 
188 aa  212  3e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0977  GTP cyclohydrolase I  58.06 
 
 
207 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1171  GTP cyclohydrolase  58.6 
 
 
198 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.121032  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  53.03 
 
 
211 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1096  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 
185 aa  193  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1274  GTP cyclohydrolase I  50.81 
 
 
185 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000261815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  55.56 
 
 
218 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  51.23 
 
 
213 aa  191  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  57.3 
 
 
220 aa  191  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  51.23 
 
 
213 aa  190  1e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  55.25 
 
 
219 aa  188  5e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  53.19 
 
 
213 aa  187  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7919  GTP cyclohydrolase I  54.49 
 
 
202 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.907663  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 
212 aa  187  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 
202 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
292 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
292 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
242 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
292 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
292 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
292 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  51.38 
 
 
236 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  50.83 
 
 
258 aa  186  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  52.31 
 
 
232 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  53.68 
 
 
229 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  54.24 
 
 
223 aa  184  5e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
234 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 
219 aa  184  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 
226 aa  184  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  53.59 
 
 
206 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.850043 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>