More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0537 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0537  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
245 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0745569  normal  0.0258493 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0874  GntR family transcriptional regulator  53.73 
 
 
226 aa  217  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0495  transcriptional regulator GntR  54.12 
 
 
249 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5735  GntR family transcriptional regulator  53.2 
 
 
224 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.419462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2447  GntR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
222 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  53.09 
 
 
224 aa  206  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3295  transcriptional regulator, GntR family  49.27 
 
 
232 aa  205  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2173  hypothetical protein  50.5 
 
 
222 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0421026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3515  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
226 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  0.6161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5376  transcriptional regulator, GntR family  51.21 
 
 
221 aa  201  1e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0423654  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0318  GntR family transcriptional regulator  49.54 
 
 
218 aa  194  8e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5853  transcriptional regulator GntR family  52.2 
 
 
221 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110749  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3518  transcriptional regulator, GntR family  52.31 
 
 
219 aa  173  2e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2681  transcriptional regulator, GntR family  45.27 
 
 
231 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4225  transcriptional regulator, GntR family  43 
 
 
215 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625874  normal  0.700845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3560  transcriptional regulator, GntR family  41.79 
 
 
236 aa  136  3e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6997  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 
232 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6353  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
232 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0048  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
194 aa  130  2e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00430  transcriptional regulator  43.84 
 
 
227 aa  127  2e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  41.62 
 
 
233 aa  114  1e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2798  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
216 aa  111  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19230  transcriptional regulator  38 
 
 
235 aa  110  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3986  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
224 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963053  normal  0.126753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4450  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
224 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3314  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 
236 aa  105  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4086  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
224 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297751  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0092  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 
236 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0178  transcriptional regulator, GntR family  38.34 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  39.16 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1313  regulatory protein GntR, HTH  37.06 
 
 
227 aa  89.7  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.568761  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
247 aa  86.3  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 
238 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0628  transcriptional regulator protein  37.71 
 
 
207 aa  84.7  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
227 aa  84.3  2e-15  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
396 aa  82.8  5e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0311  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
202 aa  82.8  5e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6333  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 
245 aa  81.3  1e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
265 aa  80.9  2e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
242 aa  80.1  3e-14  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 
232 aa  80.5  3e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 
227 aa  80.1  3e-14  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 
227 aa  80.1  3e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
242 aa  80.1  3e-14  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
242 aa  79.7  4e-14  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
242 aa  79.7  4e-14  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
241 aa  79.7  4e-14  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
267 aa  79.7  4e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
242 aa  79.3  5e-14  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
258 aa  79.3  5e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 
232 aa  79.3  5e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 
223 aa  79.3  5e-14  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
241 aa  79.3  6e-14  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17475e-07 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
222 aa  79  6e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 
244 aa  79  6e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  9.51338e-07 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  31.32 
 
 
219 aa  78.6  9e-14  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
231 aa  78.2  1e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  34.73 
 
 
222 aa  77.8  2e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  39.55 
 
 
222 aa  76.6  3e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 
209 aa  76.6  3e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
245 aa  76.6  3e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4143  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
230 aa  76.3  4e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5625  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 
240 aa  76.3  4e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.489538  decreased coverage  0.00304331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2226  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 
245 aa  76.3  5e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113996  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
253 aa  75.9  5e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
233 aa  75.9  6e-13  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 
229 aa  75.1  1e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
233 aa  74.3  1e-12  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
233 aa  74.3  1e-12  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3559  transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 
232 aa  75.1  1e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
233 aa  74.3  1e-12  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  37.64 
 
 
222 aa  73.9  2e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
229 aa  73.9  2e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
222 aa  73.9  2e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3183  Transcriptional regulators-like protein  40.26 
 
 
242 aa  73.9  2e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.138815  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
247 aa  73.2  3e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
219 aa  72.8  5e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
232 aa  72.4  7e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 
225 aa  71.2  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  39.85 
 
 
215 aa  71.2  1e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
222 aa  71.2  1e-11  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  35.9 
 
 
218 aa  71.6  1e-11  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
222 aa  71.2  1e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3595  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
222 aa  71.2  1e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
258 aa  70.9  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  28.19 
 
 
234 aa  70.5  2e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3893  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  70.9  2e-11  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  2.24678e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4146  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  70.9  2e-11  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.10084  normal  0.977946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4629  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
221 aa  70.5  2e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.470716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1979  transcriptional regulator, GntR family  28.28 
 
 
220 aa  70.5  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.053401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 
249 aa  70.1  3e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
219 aa  70.1  3e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  30.06 
 
 
229 aa  70.5  3e-11  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
249 aa  70.1  3e-11  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4995  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 
254 aa  69.7  4e-11  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349641  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
209 aa  69.7  4e-11  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
223 aa  69.7  4e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>