241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0522 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 259 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  52.68 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 230 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  40.87 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  38.4 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  35.58 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 209 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 240 aa  62  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  50.79 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  27.65 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  28.96 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  29.03 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  32.56 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  32.05 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  31.3 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  32.84 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  32.35 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 213 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  31.9 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 304 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  27.33 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  31.12 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  26.06 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  30.25 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  30.25 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  30.25 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>