More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0501 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 127 aa  243  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  77.78 
 
 		 131 aa  166  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  63.2 
 
 		 132 aa  152  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  64.52 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  62.39 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  59.84 
 
 		 127 aa  143  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  69.79 
 
 		 127 aa  140  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  65.45 
 
 		 136 aa  140  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  66.67 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  61.54 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  56.03 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  62.86 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  61.76 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  58.65 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  57.55 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  73.81 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 125 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  60 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 125 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  56.25 
 
 		 115 aa  120  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  60.4 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  57.69 
 
 		 118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  54.55 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  64.84 
 
 		 124 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  56.86 
 
 		 112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  56.31 
 
 		 126 aa  114  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  56.19 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  54.63 
 
 		 121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  63.41 
 
 		 95 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  55.1 
 
 		 121 aa  111  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  59.14 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  58.06 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  49.58 
 
 		 126 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  50.5 
 
 		 124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  58.54 
 
 		 183 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  54.95 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  51.46 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  55.42 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  53.61 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  45.22 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0711  ArsR family transcriptional regulator  74.55 
 
 		 68 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  44.04 
 
 		 336 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  49.52 
 
 		 347 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  53.85 
 
 		 349 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  47.57 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  42.24 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  42.61 
 
 		 120 aa  92.8  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 337 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  54.43 
 
 		 337 aa  88.6  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  44.35 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 119 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  43.81 
 
 		 120 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  40.87 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  41.05 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  40.87 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  46.73 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3210  arsenical resistence operon repressor ArsR  35.71 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2901  arsenical resistance operon repressor  35.71 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3224  arsenical resistance operon repressor  35.71 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.336922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2974  arsenical resistance operon repressor  35.71 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00402764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2966  arsenical resistance operon repressor  35.71 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3199  arsenical resistance operon repressor  35.71 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3326  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2922  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0200183  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  49.32 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2151  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 109 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0666  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0446  ArsR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.613441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3204  arsenical resistance operon repressor  38.16 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11581  ArsR family regulatory protein  43.21 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0535916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3189  arsenical resistance operon repressor  39.47 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2059  arsenical resistance operon repressor  35.71 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 354 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  47.5 
 
 		 328 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 117 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0688  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.812814  normal  0.550052 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  48.65 
 
 		 340 aa  70.5  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  50.65 
 
 		 349 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 341 aa  70.1  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  50.65 
 
 		 342 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1847  ArsR family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.006299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>