More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0489 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  100 
 
 		 662 aa  1265    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  48.1 
 
 		 688 aa  572  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  49.85 
 
 		 686 aa  559  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  47.58 
 
 		 901 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  50.3 
 
 		 688 aa  549  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  49.77 
 
 		 686 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 730 aa  526  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  46.07 
 
 		 707 aa  520  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  42.84 
 
 		 709 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  46.05 
 
 		 705 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  45.23 
 
 		 703 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  46.67 
 
 		 707 aa  432  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 727 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  41.54 
 
 		 671 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  33.93 
 
 		 642 aa  293  6e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 710 aa  289  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0740  major facilitator superfamily MFS_1  34.55 
 
 		 725 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  66.32 
 
 		 213 aa  229  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0575  thymidylate kinase  58.22 
 
 		 224 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589197 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0661  thymidylate kinase  57.56 
 
 		 210 aa  210  6e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.438198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32590  thymidylate kinase  52.8 
 
 		 215 aa  205  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.226657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0354  thymidylate kinase  55.98 
 
 		 281 aa  202  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  55.9 
 
 		 206 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  58.29 
 
 		 226 aa  200  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  56.02 
 
 		 232 aa  200  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  55.61 
 
 		 222 aa  200  9e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  54.45 
 
 		 234 aa  187  4e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  53.43 
 
 		 243 aa  187  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  56.37 
 
 		 225 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.38 
 
 		 211 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2194  thymidylate kinase  45.5 
 
 		 221 aa  177  5e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  44.19 
 
 		 215 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 202 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  49.75 
 
 		 224 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  42.29 
 
 		 206 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  45 
 
 		 207 aa  174  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 209 aa  173  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03690  thymidylate kinase  56.72 
 
 		 219 aa  172  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0193896  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  47.87 
 
 		 215 aa  172  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 225 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  44.34 
 
 		 206 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.27 
 
 		 205 aa  171  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  49.53 
 
 		 217 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 206 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  47.42 
 
 		 204 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1941  thymidylate kinase  51 
 
 		 209 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 206 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 206 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  44.71 
 
 		 206 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 206 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 206 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  45.27 
 
 		 219 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  48.78 
 
 		 207 aa  167  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  50.49 
 
 		 210 aa  167  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  43.59 
 
 		 207 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 212 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  43.55 
 
 		 203 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  42.31 
 
 		 216 aa  165  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  46.23 
 
 		 215 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  44.6 
 
 		 217 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 206 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  45.08 
 
 		 213 aa  164  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  45.96 
 
 		 234 aa  164  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  43.94 
 
 		 211 aa  164  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  43.19 
 
 		 212 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 206 aa  163  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 213 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  44.33 
 
 		 206 aa  162  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  47.76 
 
 		 222 aa  162  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  45.27 
 
 		 203 aa  161  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 206 aa  160  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  46.85 
 
 		 244 aa  160  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 207 aa  160  9e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 207 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 212 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 226 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  46.7 
 
 		 236 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  46.05 
 
 		 240 aa  159  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  47.35 
 
 		 244 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  44.78 
 
 		 216 aa  158  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  43.39 
 
 		 210 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  45.13 
 
 		 214 aa  158  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  47.18 
 
 		 210 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  48.11 
 
 		 217 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  48.92 
 
 		 210 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  48.11 
 
 		 217 aa  157  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  44.81 
 
 		 213 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  45.87 
 
 		 226 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  45.08 
 
 		 197 aa  156  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  44.27 
 
 		 217 aa  156  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  43.2 
 
 		 205 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  47.32 
 
 		 210 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  40.7 
 
 		 208 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>