159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0488 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  100 
 
 		 372 aa  697    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  32.58 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  31.4 
 
 		 379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  36.14 
 
 		 342 aa  119  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  33.84 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  34.86 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  29.7 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  30.06 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  32.61 
 
 		 335 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  34.88 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  33.03 
 
 		 384 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  38.2 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  33.33 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  31.79 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  35.41 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  32.12 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  32.12 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  32.93 
 
 		 368 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  35.88 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  33.64 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  31.51 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  31.51 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  35.71 
 
 		 375 aa  90.5  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  26.95 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  35.65 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  32.1 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  34.5 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  34.34 
 
 		 336 aa  86.7  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  32.05 
 
 		 338 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.36 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  33.54 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.37 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  28.31 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  33.04 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  31.53 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.97 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  29.1 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  34.52 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.26 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  29.39 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  31.72 
 
 		 357 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  31.4 
 
 		 340 aa  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  30.45 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  29.59 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  30.47 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.48 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  32.41 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  32.43 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  32.21 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  36.87 
 
 		 382 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  37.13 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  26.91 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  26.89 
 
 		 343 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  31.5 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  33.46 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  28.61 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  29.69 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  29.96 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  36.84 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  29.57 
 
 		 383 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  25.19 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  30.23 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  29.85 
 
 		 656 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  32.04 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  36.44 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  25.25 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  32.73 
 
 		 391 aa  57  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  23.57 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  29.75 
 
 		 658 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.91 
 
 		 695 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  26.53 
 
 		 379 aa  54.7  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5495  acyltransferase 3  29.64 
 
 		 587 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126637  normal  0.166118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31 
 
 		 647 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  28.08 
 
 		 395 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  31.99 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  25.62 
 
 		 660 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  27.5 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31 
 
 		 629 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2317  acyltransferase 3  23.01 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000884453  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5087  acyltransferase 3  29.02 
 
 		 627 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  26.05 
 
 		 695 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3578  acyltransferase 3  22.7 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  29.76 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  27.25 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  26.28 
 
 		 639 aa  51.2  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  27.86 
 
 		 359 aa  51.2  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  30.04 
 
 		 368 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2531  acyltransferase, putative  21.9 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0219195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2491  acyltransferase 3  33.04 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0383716  normal  0.057593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  35.16 
 
 		 675 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  26.86 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8175  acyltransferase 3  36.28 
 
 		 437 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.73 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2878  acyltransferase, putative  22.99 
 
 		 369 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  26.83 
 
 		 362 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1937  acyltransferase 3  30.26 
 
 		 369 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0298  acyltransferase 3  34.23 
 
 		 376 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  28.57 
 
 		 690 aa  49.3  0.00009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3980  acyltransferase 3  29.77 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0204358  normal  0.0459477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  31.62 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>