More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0451 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  763    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  48.22 
 
 		 430 aa  312  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  49 
 
 		 400 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.92 
 
 		 392 aa  302  7.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  49.02 
 
 		 393 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  47.62 
 
 		 405 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  48.6 
 
 		 406 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 391 aa  279  8e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 		 397 aa  279  8e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  46.29 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  46.29 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  46.29 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  46.29 
 
 		 390 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  46.29 
 
 		 390 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 390 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  46.05 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 386 aa  273  4.0000000000000004e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 		 388 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  48.69 
 
 		 400 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  48.14 
 
 		 425 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 407 aa  272  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.14 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  46.05 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  46.33 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 388 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 407 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.35 
 
 		 385 aa  268  8.999999999999999e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  44.33 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 391 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 416 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  42.59 
 
 		 391 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 391 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  42.15 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  43.9 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  44.16 
 
 		 383 aa  263  3e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  45.89 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  44.68 
 
 		 416 aa  263  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  45.61 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  45.26 
 
 		 399 aa  263  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  42.15 
 
 		 395 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  45.8 
 
 		 422 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  43.2 
 
 		 385 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  40.5 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  45.07 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  45.06 
 
 		 386 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  43.01 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 419 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.23 
 
 		 388 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  40.51 
 
 		 423 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  43.6 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  43.19 
 
 		 407 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 411 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 402 aa  255  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.74 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  43.27 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  44.85 
 
 		 392 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 391 aa  249  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  42.41 
 
 		 393 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  40.25 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  46.96 
 
 		 392 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  43.18 
 
 		 387 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  43.77 
 
 		 405 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 412 aa  246  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  43.27 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  44.07 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  44.6 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  42.59 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 405 aa  239  5.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 391 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  45.61 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  45.61 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  45.61 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  45.61 
 
 		 389 aa  239  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>