More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0389 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0389  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 364 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.198864  decreased coverage  0.00485328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3469  oxidoreductase domain-containing protein  59.33 
 
 		 370 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1146  oxidoreductase domain protein  61.88 
 
 		 365 aa  384  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17800  predicted dehydrogenase  52.37 
 
 		 380 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.50383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27070  predicted dehydrogenase  43.63 
 
 		 388 aa  271  9e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314063  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6570  oxidoreductase domain protein  37.69 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239121  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5395  hypothetical protein  38.46 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0452928  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6154  oxidoreductase domain protein  37.98 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.241078  hitchhiker  0.000628772 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2606  oxidoreductase domain protein  40.37 
 
 		 341 aa  205  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.058211  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4918  oxidoreductase domain-containing protein  35.24 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2621  oxidoreductase domain protein  37.32 
 
 		 349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4112  oxidoreductase-like  28.65 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1859  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 356 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  33.51 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0840  inositol 2-dehydrogenase  27.43 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0202  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0208  oxidoreductase domain-containing protein  27.73 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  31.67 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  31.95 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  31.25 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1608  oxidoreductase-like  29.24 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00860  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0324614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  34.04 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  27.7 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1619  oxidoreductase-like  27.97 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0345  oxidoreductase, NAD-binding  24.12 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0414  oxidoreductase domain-containing protein  24.12 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  27.69 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  30.54 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  26.61 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.16 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  25.43 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  30.8 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3353  Inositol 2-dehydrogenase  28.2 
 
 		 333 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110738  normal  0.0600563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3013  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1135  oxidoreductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022586  normal  0.596478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0831  oxidoreductase domain protein  30.65 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  30.05 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  32.93 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01870  predicted dehydrogenase  32.32 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.686021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  23.71 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  28.95 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  24.28 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3975  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000585399  hitchhiker  0.00367656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3840  oxidoreductase domain protein  36.17 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0183731  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5181  oxidoreductase domain protein  31 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2412  inositol 2-dehydrogenase  30.41 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1304  oxidoreductase-like  29.53 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0942  Inositol 2-dehydrogenase  26.27 
 
 		 337 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  28.63 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  25.74 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4096  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110624  normal  0.0525002 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1434  oxidoreductase-like  28.44 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3819  oxidoreductase-like  25.6 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0122  oxidoreductase-like protein  24.7 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  32.98 
 
 		 347 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0825  inositol 2-dehydrogenase  27.16 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1853  oxidoreductase domain-containing protein  30.21 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  26 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  24.32 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4534  oxidoreductase domain protein  29.69 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  28.34 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0316  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1076  oxidoreductase  26.78 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  24.93 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  30 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  30 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  30 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  30 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  30 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  27.37 
 
 		 366 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.63 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  29.95 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  30 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  27.63 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1256  dehydrogenase  30.32 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00213509  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  31.19 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  28.53 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3001  oxidoreductase domain protein  23.84 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888606  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2258  putative glucose-fructose oxidoreductase protein  27.2 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00555466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  29.23 
 
 		 355 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0398  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.32 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1254  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0775739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  30.3 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  25.84 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5615  NAD(P)-dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1997  oxidoreductase domain protein  25.12 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.966673  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  30.53 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2974  oxidoreductase, NAD-binding  26.14 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1658  oxidoreductase domain-containing protein  26.92 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.315746  normal  0.92431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4014  oxidoreductase domain protein  27.48 
 
 		 680 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.876961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3339  oxidoreductase domain protein  25.5 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5698  Inositol 2-dehydrogenase  23.94 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>