More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0377 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
404 aa  769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  41.63 
 
 
385 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.92 
 
 
389 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
388 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  46.3 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  40.2 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  33.11 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 
388 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
388 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  34.24 
 
 
388 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  41.51 
 
 
388 aa  123  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  37.4 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.4 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.4 
 
 
388 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.66 
 
 
382 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  28.14 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  33.46 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  33.66 
 
 
385 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  39.69 
 
 
374 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  38.73 
 
 
409 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
419 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 
408 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  25.66 
 
 
410 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 
415 aa  100  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
395 aa  99.8  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 
414 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.83 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  37.43 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2773  glycosyl transferase group 1  40.59 
 
 
385 aa  96.7  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  39.38 
 
 
378 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  36.31 
 
 
415 aa  96.3  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  31.71 
 
 
446 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
382 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  40.2 
 
 
383 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
390 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  36.31 
 
 
403 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
426 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
405 aa  93.6  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 
378 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
399 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  43.31 
 
 
373 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  36.12 
 
 
426 aa  92.8  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0160  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  35.26 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
353 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  32.85 
 
 
379 aa  92.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
375 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
375 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
375 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  36.92 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
359 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 
398 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  34.08 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
368 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
374 aa  90.5  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  40.64 
 
 
367 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  36.6 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  39.23 
 
 
374 aa  90.5  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  30.38 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
371 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
396 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  42.67 
 
 
376 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  39.9 
 
 
384 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 
385 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  29.01 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  41.89 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  39.82 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.8 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  26.97 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 
390 aa  88.2  3e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  37.5 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  34.95 
 
 
378 aa  87.4  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  35.42 
 
 
377 aa  87  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33.8 
 
 
404 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  39.87 
 
 
417 aa  86.3  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
396 aa  86.3  9e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
366 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  26.2 
 
 
387 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>