More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0315 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0315  putative CheW protein  100 
 
 		 146 aa  290  6e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0805582  normal  0.229425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3603  CheW protein  57.66 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861446  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2324  CheW protein  57.86 
 
 		 144 aa  147  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4225  CheW protein  51.09 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.497298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5006  CheW protein  59.42 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1792  CheW protein  55.56 
 
 		 140 aa  142  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.666694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1525  CheW protein  52.82 
 
 		 152 aa  140  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361906  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30980  CheW protein  53.28 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2003  CheW protein  53.28 
 
 		 140 aa  123  7e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0578815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1873  CheW protein  44.14 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1818  CheW protein  44.14 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3919  CheW protein  44.14 
 
 		 167 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3802  CheW protein  42.36 
 
 		 164 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1907  CheW domain protein  45.07 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3677  CheW-like protein  42.76 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.340799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4246  CheW protein  43.07 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1713  CheW protein  43.38 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1810  CheW protein  44.12 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.000143406  normal  0.276017 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1530  CheW domain-containing protein  44.12 
 
 		 159 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843757 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  43.38 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0659  CheW protein  38.89 
 
 		 161 aa  103  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.575233  normal  0.716686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1692  CheW protein  41.18 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135374  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3375  CheW protein  41.61 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0270944  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2562  CheW protein  41.35 
 
 		 167 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.424252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4837  CheW protein  39.71 
 
 		 169 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.55891  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6558  CheW protein  37.76 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.675554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  36.96 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  38.13 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4034  CheW protein  40.29 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.488441  normal  0.598337 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  33.58 
 
 		 170 aa  94  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0213  CheW protein  48.25 
 
 		 141 aa  93.6  7e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178938  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  30.66 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  34.07 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  37.31 
 
 		 161 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  35.97 
 
 		 162 aa  90.5  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  29.93 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  36.5 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  37.5 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  37.31 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.96 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.96 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  35.82 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  33.58 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  35.77 
 
 		 161 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  35.77 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.23 
 
 		 164 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.77 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  87  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  34.31 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  33.58 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.77 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  33.82 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  35.04 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  35.07 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  35.77 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  35.04 
 
 		 163 aa  85.5  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  34.33 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  35.04 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  32.09 
 
 		 160 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  34.33 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0989  CheW protein  35.61 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  33.58 
 
 		 173 aa  84  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1450  putative CheW protein  32.85 
 
 		 148 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  32.59 
 
 		 168 aa  83.6  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  32.84 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  35.07 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  34.31 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  32.61 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  31.11 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  32.61 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  34.33 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.33 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  34.33 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  34.33 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  36.13 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.58 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.58 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  34.51 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  32.39 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  33.8 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  27.89 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.13 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.29 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  32.39 
 
 		 179 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0334  CheW protein  36.17 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  34.78 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  27.07 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  33.58 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  32.09 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  32.09 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.58 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>