More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0308 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0308  Quinone oxidoreductase putative PIG3  100 
 
 
329 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166873  normal  0.0546383 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5274  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  62.96 
 
 
324 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315369  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0072  putative quinone oxidoreductase  63.91 
 
 
328 aa  388  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  66.36 
 
 
329 aa  381  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase  63.16 
 
 
320 aa  383  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  63.89 
 
 
325 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0139  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  64.44 
 
 
324 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01620  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  60.06 
 
 
324 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.452683  normal  0.18049 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04120  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.44 
 
 
326 aa  349  4e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0587726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0076  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.82 
 
 
333 aa  348  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2101  alcohol dehydrogenase  59.88 
 
 
353 aa  342  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0146  hypothetical protein  59.57 
 
 
318 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.639279  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1189  alcohol dehydrogenase  58.23 
 
 
324 aa  338  9e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0796506  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0261  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family  58.1 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5369  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
327 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5076  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
327 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4988  zinc-binding alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
327 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0827  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  55.52 
 
 
327 aa  335  9e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0289  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.28 
 
 
343 aa  335  9e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13811  oxidoreductase  55.21 
 
 
328 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.334281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  52.16 
 
 
332 aa  331  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  56.13 
 
 
327 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 
333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  54.01 
 
 
323 aa  325  5e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2269  alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 
325 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.609363  normal  0.353515 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0282  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  58.31 
 
 
317 aa  325  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.221318  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5615  alcohol dehydrogenase  57.63 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  55.28 
 
 
328 aa  324  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4983  quinone oxidoreductase putative PIG3  58.59 
 
 
325 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828974 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  55.28 
 
 
328 aa  322  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4322  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.75 
 
 
316 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0286  quinone oxidoreductase putative PIG3  59.03 
 
 
316 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  54.8 
 
 
335 aa  312  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.3 
 
 
338 aa  310  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1400  putative oxidoreductase  51.68 
 
 
328 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250698  normal  0.859158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  53.21 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.34 
 
 
331 aa  309  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3889  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.48 
 
 
327 aa  309  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0106783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3513  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.7 
 
 
332 aa  308  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4470  alcohol dehydrogenase  57.98 
 
 
325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0103957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.85 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0790  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50 
 
 
332 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.557633  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2835  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  48.31 
 
 
336 aa  305  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.548678  normal  0.0828757 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1628  NAD(P)H quinone oxidoreductase PIG3 family protein  48.31 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.91592  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1737  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.31 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.99 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1421  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
328 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.329705  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  47.72 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3056  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.07 
 
 
335 aa  302  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0840  quinone oxidoreductase putative PIG3  51.85 
 
 
341 aa  302  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6946  putative NADPH quinone oxidoreductase  50.46 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0958  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.95 
 
 
334 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.761885  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2065  putative NADPH quinone oxidoreductase protein  51.19 
 
 
334 aa  300  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.465224  normal  0.69391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2012  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.38 
 
 
338 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00591835  normal  0.606221 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4494  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 
332 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218287  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  50.31 
 
 
332 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3259  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.82 
 
 
340 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1697  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.6 
 
 
336 aa  298  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50.91 
 
 
335 aa  297  1e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  49.38 
 
 
332 aa  297  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0170  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  49.85 
 
 
322 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1484  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.38 
 
 
342 aa  296  4e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.269368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.41 
 
 
334 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0103733  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1826  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.29 
 
 
336 aa  295  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.448305 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0100  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  51.68 
 
 
328 aa  295  7e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2217  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.71 
 
 
334 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.573138 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1546  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.99 
 
 
336 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  0.0877098 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0248  quinone oxidoreductase putative PIG3  51.55 
 
 
328 aa  293  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.39 
 
 
336 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0869  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  52.6 
 
 
334 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3548  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.46 
 
 
332 aa  294  2e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1054  alcohol dehydrogenase  45.92 
 
 
332 aa  292  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0985  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  48.15 
 
 
332 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567707  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.08 
 
 
338 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5183  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  51.84 
 
 
333 aa  291  9e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.641373  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2169  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  48.38 
 
 
339 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0111433  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1056  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  50.46 
 
 
334 aa  291  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.691912  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2290  alcohol dehydrogenase  48.38 
 
 
339 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0954  alcohol dehydrogenase  52.29 
 
 
334 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000352815 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1156  quinone oxidoreductase  49.23 
 
 
389 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.31 
 
 
334 aa  291  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1498  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  52.15 
 
 
328 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  50.46 
 
 
326 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3217  putative NADPH quinone oxidoreductase  49.56 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00040728  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2517  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.11 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01790  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.33 
 
 
332 aa  288  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1340  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  49.26 
 
 
338 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00600285  normal  0.0548785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4094  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  53.17 
 
 
325 aa  287  1e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6553  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  47.83 
 
 
320 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2750  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.46 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.0529878 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1174  quinone oxidoreductase putative PIG3  49.54 
 
 
334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0397  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  56.23 
 
 
327 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.364406  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2867  alcohol dehydrogenase  49.07 
 
 
333 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.686994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1431  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.67 
 
 
360 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  50 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1833  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.67 
 
 
339 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1286  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  48.67 
 
 
339 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1126  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.67 
 
 
339 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0741  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.67 
 
 
339 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.413421  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0409  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  48.67 
 
 
339 aa  285  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>