More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0296 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
301 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18870  carbohydrate ABC transporter membrane protein  61.83 
 
 
319 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.858818  normal  0.355174 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.55 
 
 
300 aa  352  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal  0.306181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.54 
 
 
307 aa  343  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.55 
 
 
304 aa  316  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.12 
 
 
284 aa  299  4e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  52.2 
 
 
304 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.47 
 
 
297 aa  278  8e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.74 
 
 
303 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30850  ABC-type sugar transport system, permease component  45.67 
 
 
315 aa  266  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
299 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.86 
 
 
299 aa  262  6e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
296 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  47.6 
 
 
275 aa  254  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.154885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  38.11 
 
 
277 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  37.74 
 
 
277 aa  209  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 
274 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.59 
 
 
311 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
271 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
273 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.46 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
270 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.15 
 
 
302 aa  195  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
268 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
275 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 
275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
279 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
294 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.466926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
295 aa  188  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
281 aa  188  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.91 
 
 
295 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
298 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0605  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
273 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
276 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0482  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
273 aa  185  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4734  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
273 aa  185  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
298 aa  185  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0631  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  34.09 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0537  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  34.47 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0479  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  34.47 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0481  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  34.47 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0568  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  34.47 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0624  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
270 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0699  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  34.09 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 
701 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
279 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0553602  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.14 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  38.58 
 
 
273 aa  182  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
272 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
273 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
275 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
270 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
285 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  33.7 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.47 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  39.37 
 
 
701 aa  179  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
268 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3019  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.34 
 
 
278 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
272 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  36.03 
 
 
272 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
310 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 
277 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
324 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0063  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
291 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
277 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
271 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
279 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
722 aa  176  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2742  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3724  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
278 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3211  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.198924  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1762  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3753  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2792  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  176  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0236  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.04 
 
 
281 aa  175  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.325941 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3695  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
278 aa  175  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  35.71 
 
 
269 aa  175  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0325  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.77 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.579383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0316  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.13 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2711  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  36.5 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027951  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.52 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
268 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0300  glycerol-3-phosphate transporter membrane protein  35.04 
 
 
281 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>