56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0292 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0292  YibE/F family protein  100 
 
 		 404 aa  770    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.502683  normal  0.0969675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0151  YibE/F family protein  45.87 
 
 		 438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0309546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2506  YibE/F family protein  36.34 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.416194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1777  YibE/F family protein  39.66 
 
 		 422 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0836045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3598  YibE/F family protein  40 
 
 		 428 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36270  predicted multitransmembrane protein  38.26 
 
 		 484 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1371  YibE/F family protein  35.17 
 
 		 484 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000298866 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1706  YibE/F family protein  39.36 
 
 		 513 aa  223  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0616  YibE/F family protein  38.71 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1335  YibE/F family protein  36.06 
 
 		 499 aa  219  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4623  YibE/F family protein  44.79 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0949625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0617  YibE/F family protein  38.33 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225708  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3310  YibE/F family protein  40.87 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15190  predicted multitransmembrane protein  40.65 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0772315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0164  YibE/F family protein  44.32 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00530836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0460  YibE/F family protein  43.75 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0281  YibE/F family protein  38.52 
 
 		 413 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.715715  normal  0.837418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2203  YibE/F family protein  40.67 
 
 		 599 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0427  YibE/F family protein  37.94 
 
 		 410 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0450  YibE/F family protein  38.29 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0440  YibE/F-like protein  38.29 
 
 		 424 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270973  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1586  YibE/F family protein  42.96 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.728201  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4407  YibE/F family protein  42.15 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.689016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0444  YibE/F family protein  37.08 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0532  YibE/F family protein  34.44 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.155623  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5754  YibE/F family protein  38.71 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1474  YibE/F family protein  38.27 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.649458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1552  YibE/F family protein  34.25 
 
 		 392 aa  135  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000166872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2717  YibE/F family protein  30.43 
 
 		 393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00980244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2084  YibE/F family protein  33.76 
 
 		 446 aa  126  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0158953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1717  YibE/F family protein  29.73 
 
 		 373 aa  117  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000872311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2256  hypothetical protein  25.93 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000922663  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2866  YibE/F family protein  31.44 
 
 		 451 aa  110  6e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.405695  hitchhiker  0.000000000000397965 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4236  YibE/F family protein  26.51 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2300  YibE/F family protein  35.47 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681983  normal  0.658547 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18650  predicted multitransmembrane protein  27.34 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.221349  normal  0.497385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1617  YbiE/YbiF family membrane protein  25.57 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0997624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1156  YibE/F family protein  25.85 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2695  hypothetical protein  26.13 
 
 		 434 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0625  YibE/F family protein  27.21 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0617008  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01199  hypothetical protein  26.42 
 
 		 396 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0503  hypothetical protein  26.09 
 
 		 260 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.84165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0490  hypothetical protein  26.09 
 
 		 260 aa  87  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.45051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0869  hypothetical protein  23.74 
 
 		 370 aa  86.7  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0893767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0105  hypothetical protein  23.66 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0491  hypothetical protein  25.69 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0504  hypothetical protein  25.69 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.36708  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2291  YibE/F family protein  25.17 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0106  hypothetical protein  25.45 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0513  YibE/F family protein  26.55 
 
 		 386 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1217  multitransmembrane protein-like  27.83 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0923  YibE/F family protein  23.33 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0732684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0532  multitransmembrane protein  24.6 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0111  multitransmembrane protein  23.64 
 
 		 253 aa  45.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000423826 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0458  YibE/F family protein  24.61 
 
 		 371 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000650445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0365  multitransmembrane protein  21.2 
 
 		 258 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>