58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0273 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  100 
 
 		 1146 aa  2246    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1151 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  37.72 
 
 		 1125 aa  534  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  35.64 
 
 		 1114 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  36.43 
 
 		 1120 aa  513  1e-144  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  29.72 
 
 		 1124 aa  339  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1126 aa  323  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  28.77 
 
 		 1143 aa  308  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1128 aa  295  3e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  27.55 
 
 		 1136 aa  287  9e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  26.56 
 
 		 1137 aa  255  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1118 aa  247  8e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  28.08 
 
 		 1120 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  26.88 
 
 		 1154 aa  232  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  26.45 
 
 		 1153 aa  229  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  25.81 
 
 		 1126 aa  207  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1122 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  25.31 
 
 		 1118 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1120 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1120 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1121 aa  202  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  25.46 
 
 		 1120 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1125 aa  199  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1121 aa  198  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1121 aa  196  2e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  26.98 
 
 		 1140 aa  195  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1121 aa  192  2e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1121 aa  190  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1125 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1123 aa  190  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  26.14 
 
 		 1121 aa  187  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.51 
 
 		 1144 aa  185  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1143 aa  183  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1181 aa  179  3e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  25.84 
 
 		 1124 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1133 aa  174  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  26.7 
 
 		 1130 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1166 aa  124  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.23 
 
 		 1133 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.72 
 
 		 1045 aa  91.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  22.1 
 
 		 979 aa  90.1  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  21.72 
 
 		 694 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  30.54 
 
 		 352 aa  67.8  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  25.31 
 
 		 462 aa  63.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  25.57 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  24 
 
 		 1109 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  32.97 
 
 		 1159 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1159 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1145 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  32.97 
 
 		 1159 aa  48.5  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2198  cell division protein MukB  27.97 
 
 		 1477 aa  47.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2299  cell division protein MukB  27.97 
 
 		 1478 aa  47  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  23.67 
 
 		 1093 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1779  cell division protein MukB  26.92 
 
 		 1479 aa  45.8  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2051  cell division protein MukB  26.92 
 
 		 1479 aa  45.8  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962316  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2655  cell division protein MukB  26.27 
 
 		 1485 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1971  cell division protein MukB  26.27 
 
 		 1485 aa  45.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2565  cell division protein MukB  26.27 
 
 		 1485 aa  45.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>